Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  236  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67016757--67016793
19
1.9
19
100
0
74
24
21
16
37
1.93
67019972--67020143
67
2.6
66
81
7
170
31
16
29
22
1.96
67019996--67020179
67
2.8
64
78
8
203
28
16
30
23
1.96
67024392--67024563
67
2.6
66
81
7
170
31
16
29
22
1.96
67024416--67024599
67
2.8
64
78
8
203
28
16
30
23
1.96
67028383--67028411
11
2.6
11
100
0
58
41
27
13
17
1.87
67028626--67028799
48
3.6
48
76
6
156
21
24
21
32
1.98
67029197--67029568
70
5.3
70
91
1
595
38
17
13
30
1.88
67031405--67031439
16
2.1
17
89
5
54
42
8
2
45
1.49
67031759--67031834
38
2.0
38
97
0
143
52
22
10
14
1.72
67041301--67041430
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
67047261--67047411
40
3.8
39
84
2
151
23
27
23
26
2.00
67047261--67047411
80
1.9
79
83
6
198
23
27
23
26
2.00
67055194--67055344
40
3.8
39
84
2
151
23
27
23
26
2.00
67055194--67055344
80
1.9
79
83
6
198
23
27
23
26
2.00
67059104--67059141
20
1.9
20
94
0
67
28
21
21
28
1.98
67063216--67063381
40
4.2
40
81
3
176
24
27
21
26
1.99
67065400--67065449
25
2.0
25
96
0
91
46
0
18
36
1.49
67066056--67066697
43
15.0
43
85
6
849
25
17
27
28
1.98
67066845--67067099
43
6.0
43
85
4
338
26
16
27
29
1.97
67066845--67067091
127
1.9
129
89
3
383
27
16
27
29
1.97
67066443--67067259
402
2.0
405
93
1
1390
29
14
24
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67067251--67067281
16
1.9
16
93
0
53
41
6
16
35
1.74
67070487--67070577
29
3.2
28
85
3
96
23
15
34
27
1.94
67070504--67070572
28
2.4
29
92
2
113
24
14
33
27
1.94
67071252--67071277
11
2.4
11
100
0
52
26
0
19
53
1.45
67072141--67072395
55
4.8
54
80
9
269
35
18
25
21
1.95
67077817--67077841
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
67077895--67077924
15
1.9
16
93
6
53
36
13
0
50
1.42
67078926--67079109
64
2.8
64
80
8
194
22
29
17
30
1.97
67079844--67079904
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
67085481--67085539
20
2.9
21
79
5
75
72
5
15
6
1.23
67085522--67085570
16
3.3
14
75
13
53
79
2
14
4
0.97
67085482--67085548
21
3.2
21
78
4
73
73
5
14
5
1.23
67085511--67085557
23
2.0
23
87
0
67
80
4
12
2
0.94
67085480--67085568
41
2.2
40
78
13
92
74
4
15
5
1.17
67086085--67086172
21
4.2
21
79
0
86
30
37
14
17
1.90
67092580--67092857
48
5.8
48
90
1
425
26
25
18
28
1.98
67096552--67096724
46
3.7
46
77
13
201
21
20
28
30
1.98
67096549--67096719
93
1.8
93
93
0
297
21
20
29
29
1.98
67098689--67098834
40
3.7
40
84
5
188
26
26
21
24
2.00
67102270--67102318
21
2.3
21
79
6
55
18
34
30
16
1.93
67107639--67107665
13
2.1
13
100
0
54
51
18
22
7
1.70
67115606--67115646
21
2.0
21
90
0
64
24
7
41
26
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67118634--67118666
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
67130550--67130665
46
2.5
46
92
0
196
51
12
2
33
1.53
67136137--67136170
16
2.2
15
89
5
50
50
0
0
50
1.00
67136302--67136383
41
2.0
41
97
0
155
37
9
2
50
1.49
67137291--67137367
10
7.7
10
72
10
50
67
3
1
27
1.16
67137291--67137367
30
2.6
29
77
6
91
67
3
1
27
1.16
67137537--67137593
19
3.0
18
78
17
62
28
8
3
59
1.44
67137535--67137586
19
2.7
20
77
16
65
26
5
3
63
1.34
67137535--67137592
20
3.1
19
74
20
59
27
8
3
60
1.42
67137631--67137768
19
7.4
18
71
17
86
32
1
0
65
1.07
67137627--67137768
29
5.0
28
68
16
89
33
1
0
64
1.07
67137632--67137755
10
12.9
10
73
13
84
34
0
0
63
1.06
67139244--67139335
19
4.9
19
94
5
170
38
10
15
35
1.82
67139236--67139342
36
3.0
36
84
13
141
38
11
14
35
1.82
67139244--67139358
19
5.8
22
89
8
105
37
9
15
37
1.80
67139724--67139753
6
5.0
6
100
0
60
16
16
16
50
1.79
67139768--67140130
181
2.0
180
98
0
708
23
20
23
31
1.98
67140704--67140788
42
2.0
42
100
0
170
29
18
23
28
1.98
67147472--67147687
78
2.8
78
91
0
351
32
19
23
24
1.98
67147793--67147850
29
2.0
30
89
3
91
32
12
37
17
1.86
67148241--67148296
18
3.5
15
81
18
60
37
10
16
35
1.83
67148239--67148317
35
2.2
37
86
13
121
37
10
16
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67148239--67148310
19
3.9
19
89
10
123
37
11
15
36
1.83
67148239--67148333
17
4.8
22
84
12
79
36
9
15
37
1.80
67151081--67151187
51
2.1
52
98
1
207
43
9
27
19
1.81
67156886--67157064
49
3.6
49
93
0
277
29
29
17
24
1.97
67156886--67157064
99
1.8
98
88
1
277
29
29
17
24
1.97
67169670--67169705
14
2.4
16
86
13
58
66
0
0
33
0.92
67169671--67169705
7
4.7
7
89
10
52
68
0
0
31
0.90
67171656--67171695
13
3.2
13
89
7
64
82
0
17
0
0.67
67171656--67171695
6
6.5
6
88
5
62
82
0
17
0
0.67
67172085--67172109
8
3.1
8
100
0
50
88
0
0
12
0.53
67173141--67173168
13
2.2
13
100
0
56
67
0
17
14
1.22
67176147--67176196
13
3.8
13
81
5
57
34
6
26
34
1.81
67176390--67176436
24
1.9
25
86
4
69
48
2
2
46
1.25
67177810--67177852
20
2.2
20
86
0
59
34
0
2
62
1.08
67182494--67182538
21
2.1
21
91
0
72
35
2
2
60
1.22
67182508--67182605
17
6.3
15
78
15
94
31
4
1
63
1.20
67182570--67182605
7
5.0
7
86
6
54
30
0
0
69
0.89
67194553--67195041
44
11.1
44
87
2
662
28
15
28
26
1.96
67196597--67196728
29
4.6
29
88
0
165
29
15
31
24
1.95
67199675--67199723
25
2.0
25
87
0
71
36
4
2
57
1.30
67199668--67199778
10
10.7
10
69
20
52
31
6
1
60
1.32
67199687--67199731
7
6.7
7
78
17
51
40
2
0
57
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67199755--67199788
7
4.7
7
85
7
50
29
0
0
70
0.87
67199694--67199788
33
3.0
29
69
24
68
31
5
1
62
1.24
67204852--67204912
29
2.1
28
90
3
95
29
14
27
27
1.95
67204859--67204975
29
4.0
29
85
0
135
28
13
30
27
1.94
67207564--67207692
40
3.2
40
80
3
154
23
23
28
24
1.99
67215477--67215627
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
22
2.00
67215514--67215643
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
67220433--67220505
29
2.5
29
90
0
92
24
31
16
27
1.96
67222406--67222664
40
6.5
40
94
1
425
23
22
27
26
2.00
67228231--67228424
44
4.4
45
78
3
191
25
22
19
33
1.97
67234875--67235089
46
4.6
46
77
11
149
26
19
30
23
1.98
67238212--67238237
13
2.0
13
100
0
52
23
7
15
53
1.67
67255230--67255255
7
3.7
7
100
0
52
0
11
46
42
1.40
67256719--67256806
29
3.1
28
88
1
131
29
15
25
29
1.96
67256719--67256837
58
2.1
58
82
3
143
30
14
25
30
1.95
67258231--67258269
19
2.1
19
95
0
69
51
12
10
25
1.71
67265685--67265717
14
2.4
14
90
5
50
21
9
0
69
1.15
67270115--67270140
6
4.3
6
100
0
52
30
0
0
69
0.89
67273059--67273115
29
2.0
28
86
3
78
40
1
0
57
1.09
67273071--67273118
21
2.3
21
82
13
55
41
0
0
58
0.98
67273384--67273428
21
2.1
21
100
0
90
35
0
4
60
1.17
67277650--67277688
15
2.7
15
84
4
53
61
2
0
35
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67278873--67278916
19
2.2
20
92
4
72
27
9
11
52
1.67
67278997--67279076
40
2.0
40
80
4
90
40
3
3
52
1.37
67282022--67282056
17
2.1
16
89
5
52
60
0
0
40
0.97
67286582--67286639
29
2.0
29
100
0
116
31
20
17
31
1.96
67286764--67286806
22
2.0
22
95
4
79
62
0
0
37
0.95
67288187--67288217
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
67291128--67291263
26
5.2
26
97
0
245
34
5
23
36
1.77
67293052--67293337
137
2.1
136
95
0
509
24
18
25
32
1.97
67295370--67295398
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
67297076--67297478
177
2.3
170
83
8
489
27
21
19
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427