Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  78  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19458536--19458590
23
2.5
23
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5
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34
7
16
41
1.76
19458975--19459015
16
2.5
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60
0
0
39
0.96
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2.4
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17
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22
1.94
19462626--19462718
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2.1
44
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0
159
47
3
26
22
1.66
19462659--19462879
66
3.3
66
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279
44
3
26
26
1.69
19471124--19471268
39
3.7
39
92
0
218
20
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23
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1.98
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26
24
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21
2.00
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3.2
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23
23
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19474130--19474297
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2.1
80
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26
23
27
22
2.00
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3.8
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11
141
26
24
27
21
2.00
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40
3.2
40
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2
154
23
23
28
23
2.00
19480327--19480494
80
2.1
80
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207
26
23
27
22
2.00
19486114--19486243
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2.8
48
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29
20
20
1.98
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3.6
39
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138
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29
22
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1.99
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1.22
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27
9
0
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1.24
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39.7
3
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20
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30
3
2
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1.24
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2.0
26
100
0
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43
1.82
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2.4
46
77
2
127
35
14
21
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19509803--19510061
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4
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32
16
22
28
1.96
19509802--19510265
89
5.2
89
72
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266
31
19
20
28
1.97
19509849--19510265
44
9.4
45
69
7
192
30
19
21
29
1.97
19509799--19510103
134
2.3
134
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2
434
31
18
21
28
1.97
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2.0
177
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1
543
29
20
20
29
1.98
19510033--19510303
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89
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7
289
28
22
19
29
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5
10.0
5
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1
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57
14
0
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82
0.75
19510684--19510733
16
3.1
16
80
13
66
16
0
2
82
0.77
19515721--19515758
18
2.1
18
95
0
67
42
47
2
7
1.46
19515735--19515759
13
1.9
13
100
0
50
40
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0
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6
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75
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0
16
1.02
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25
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8
82
73
8
0
18
1.07
19515856--19515941
9
9.6
9
88
0
109
27
9
18
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1.80
19517880--19517912
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2.1
16
94
0
57
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9
9
6
1.18
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23
4.0
23
80
0
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36
51
1.49
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2.1
27
96
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37
10
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35
1.83
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1.9
20
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10
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44
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21
1.85
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46
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537
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23
23
1.93
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130
3.0
130
92
3
615
37
15
23
23
1.93
19525750--19526089
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2.0
168
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4
554
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15
24
23
1.94
19528046--19528070
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19544818--19544886
23
3.0
23
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111
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0
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1.34
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32
1.45
19547130--19547182
24
2.2
24
86
0
70
54
9
3
32
1.50
19547384--19547923
268
2.0
266
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764
43
7
7
41
1.61
19547848--19547900
24
2.2
24
89
0
79
37
1
5
54
1.35
19554949--19555018
22
3.3
22
69
18
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20
30
24
25
1.99
19554945--19555026
41
2.0
41
100
0
164
21
29
24
24
1.99
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2.2
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10
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0
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16
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20
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0
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0
0
27
0.85
19614984--19615030
22
2.2
22
84
3
60
8
25
0
65
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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29
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0
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18
53
30
3
1
65
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19660970--19661023
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19673135--19673412
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119
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206
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0
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0
13
2
0.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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103
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0
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14
26
27
31
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427