Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7155920--7155958
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2.0
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2.2
20
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2
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0
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1.9
21
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23
23
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21
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3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
7204476--7204647
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
7218766--7218811
19
2.3
20
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7
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10
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20
1.9
20
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0
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2.2
18
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8
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30
22
0
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
3
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3
96
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0
0
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0
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0
6
57
1.24
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10
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21
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2.5
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100
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111
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18
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23
87
4
67
63
4
8
23
1.40
7233731--7233778
12
4.1
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58
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54
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1
35
1.39
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2.0
22
82
0
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2
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2.4
11
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0
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0
0
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2.5
263
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17
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2.2
12
100
0
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61
0
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19
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21
2.1
21
95
0
79
22
34
4
38
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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197
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1.75
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2.3
19
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2
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2.8
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23
2
43
1.67
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3.9
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3.0
27
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10
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17
25
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1.00
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29
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63
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0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7302162--7302214
18
3.1
18
77
22
60
67
0
0
32
0.91
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16
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0
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75
0
0
24
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2.0
24
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74
0
4
21
0.99
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15
1.9
16
93
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53
46
6
0
46
1.29
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22
2.1
22
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31
14
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1.22
7304569--7304674
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20
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25
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0
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28
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20
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20
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15
69
42
1
1
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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20
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0
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2
2
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1.9
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29
29
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20
1.98
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6
0
17
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7393726--7393773
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0
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0
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24
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1.57
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2.2
29
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4
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0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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