Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  357  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103774428--103774634
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132
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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15
10
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1.82
103812990--103813068
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128
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103813283--103813379
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2.2
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2.7
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0
32
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.16
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30
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6
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6
3
37
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2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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20
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6
0
45
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20
100
0
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23
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1.94
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26
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0
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27
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24
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19
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1.87
103891028--103891216
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19
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2.0
203
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1
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0
0
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12
82
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795
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1
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9
12
25
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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28
1.31
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2.3
34
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6
25
1.35
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2.4
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6
29
1.52
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26
2.0
26
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102
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1.57
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0
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23
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19
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0
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1.03
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0
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0
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1.9
55
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0
136
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21
0
34
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103973108--103973164
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24
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0
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103973162--103973208
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2.7
17
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1.54
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0
117
12
25
26
34
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427