Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12279835--12280446
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2.2
29
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1.48
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2.5
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31
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5
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12281500--12281550
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2.4
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59
27
9
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1.26
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83
4
57
40
0
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52
1.31
12285465--12285522
21
2.8
21
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29
8
0
62
1.25
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0
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0
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63
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3.0
227
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19
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12297243--12297646
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128
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2
405
27
26
19
26
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12297509--12297668
43
3.7
43
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26
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1.9
19
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86
79
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385
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18
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25
1.98
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9.7
43
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5
335
29
19
25
25
1.98
12311655--12311938
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2.1
137
90
1
453
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5
41
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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5
20
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12317841--12317909
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1.9
35
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95
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11
4
7
1.12
12317840--12317900
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3.3
19
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13
56
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13
4
6
1.16
12317859--12317913
28
1.9
29
82
10
69
76
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5
9
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17
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17
10
0
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1.12
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29
82
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22
10
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0
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149
35
13
22
27
1.92
12336333--12336466
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3.0
45
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153
35
14
23
26
1.93
12343230--12343344
44
2.6
44
83
2
140
35
13
22
28
1.92
12343230--12343363
46
3.0
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4
135
35
13
23
27
1.93
12347286--12347661
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1.10
12348469--12348536
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1.9
35
85
11
95
76
11
4
7
1.13
12348466--12348543
34
2.4
33
80
16
90
75
12
3
7
1.15
12348732--12348770
17
2.3
17
86
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53
17
10
0
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1.12
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2.0
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2.7
11
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0
51
40
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12355250--12355356
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3.4
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200
36
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10
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12355372--12355543
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2.4
72
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51
1.50
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0
14
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1.46
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2.7
73
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34
1
13
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1.48
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0
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0
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1.72
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41
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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2
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5
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28
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2
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43
2.2
44
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6
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1.65
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2.3
19
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4
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1.67
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2.0
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30
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0
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0
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0
54
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40
0
48
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
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3
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3
0
36
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12526790--12526820
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0
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0
0
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2.3
29
80
10
84
50
1
1
46
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427