Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  297  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86018558--86018684
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22
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10
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22
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19
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1.96
86018868--86018929
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0
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17
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100
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20
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57
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4.6
35
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192
33
23
10
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86091832--86092003
75
2.4
73
83
8
217
33
23
11
31
1.90
86091837--86092003
35
4.6
35
86
7
192
33
23
10
31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
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4
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4
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0
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0
25
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2.1
21
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0
0
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19
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21
53
68
3
0
28
1.05
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2.3
130
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2
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19
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1.92
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2.3
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1
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31
1.93
86116424--86116792
192
1.9
192
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1
488
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13
19
31
1.91
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129
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1.88
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2.1
24
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0
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0
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0
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31
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53
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1.65
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2.3
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10
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32
1.78
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22
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50
0
0
50
1.00
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13
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1.12
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1
47
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63
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63
93
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38
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2.3
12
100
0
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0
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1.20
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116
1.9
116
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329
40
19
9
30
1.84
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29
2.3
30
84
7
84
49
7
14
28
1.71
86162128--86162216
25
3.5
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72
15
87
20
24
22
32
1.98
86162196--86162278
25
3.3
25
77
9
89
26
28
19
25
1.98
86163958--86164041
32
2.6
32
84
1
123
36
15
20
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86165129--86165184
19
3.3
19
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61
26
25
26
21
1.99
86165128--86165206
32
2.5
32
93
0
131
26
27
26
18
1.98
86168060--86168116
25
2.4
23
79
5
60
29
1
5
63
1.27
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32
2.4
32
97
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147
35
16
21
25
1.94
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94
1.9
94
85
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248
28
20
29
21
1.98
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44
75
13
147
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20
27
23
1.99
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2.2
55
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159
22
21
29
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1.99
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28
21
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1.99
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27
20
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1.8
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93
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27
21
22
1.99
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198
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27
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22
1.99
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0
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45
77
4
149
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18
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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86244337--86244372
10
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1.84
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45
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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16
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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22
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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