Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5457245--5457302
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153
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2.0
34
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0
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3.1
11
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21
86
0
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21
20
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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100
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2.0
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22
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21
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18
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16
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4.3
45
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24
27
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2.0
89
88
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264
25
28
14
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1.95
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78
88
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418
24
23
19
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1.98
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426
25
24
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365
2.3
364
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2
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25
23
17
32
1.97
5555854--5556573
287
2.5
284
80
8
716
25
24
17
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
19
32
1.93
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4.1
140
92
4
962
33
15
19
31
1.94
5560256--5560844
217
2.7
217
96
2
1075
33
15
19
31
1.94
5560276--5560945
147
4.7
142
85
10
668
31
16
20
31
1.95
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3.0
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11
194
29
16
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1.93
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3.0
35
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1.44
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13
1.51
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2.7
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100
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10
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21
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26
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1
184
36
24
4
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1.76
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2.2
12
100
0
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0
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0
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20
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4
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25
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0
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22
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0
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0.92
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4.2
11
86
5
67
21
2
0
76
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5600090--5600121
2
16.0
2
93
0
55
46
0
0
53
1.00
5604654--5604740
43
2.0
43
95
0
156
32
9
24
34
1.87
5608615--5608652
17
2.2
17
100
0
76
36
15
15
31
1.90
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61
2.0
61
98
0
235
29
13
4
51
1.62
5613344--5613398
27
2.0
27
92
0
92
30
20
18
30
1.96
5617920--5617950
14
2.3
14
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5
55
25
3
12
58
1.50
5621584--5621624
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
5628459--5628760
153
2.0
153
84
3
394
25
21
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1.95
5630606--5630650
22
2.0
22
100
0
90
35
4
17
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1.70
5636232--5636292
30
2.0
30
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0
86
39
6
22
31
1.80
5636991--5637213
67
3.4
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11
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30
17
29
23
1.97
5638296--5638341
2
23.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
5649658--5649694
15
2.3
17
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9
51
51
0
27
21
1.48
5657963--5658016
18
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16
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19
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22
3
1
72
1.10
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12
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12
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20
3
2
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1.12
5657970--5658006
19
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19
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24
5
0
70
1.08
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10
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10
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0
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0
7
80
0.89
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3
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3
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10
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28
4
4
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1.34
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12
2.2
12
100
0
52
19
15
26
38
1.91
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25
2.0
25
96
0
93
52
7
9
29
1.62
5670023--5670096
37
2.0
37
100
0
148
54
16
10
18
1.71
5671777--5671868
29
3.2
28
70
21
73
38
2
6
53
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5672666--5672719
27
2.0
27
100
0
108
48
22
7
22
1.75
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19
2.0
19
89
0
58
47
5
5
42
1.48
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23
5.5
21
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18
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56
3
6
33
1.41
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15
1.9
16
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6
53
70
0
0
30
0.88
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21
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1
2
33
1.17
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1.9
25
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0
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29
0
4
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1.10
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19
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26
1
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1.29
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2.0
21
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0
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2.0
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0
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1.80
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1.9
16
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0
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16
12
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2
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0
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0
0
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1.9
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10
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1.84
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25
2.9
25
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7
105
22
22
17
36
1.95
5714230--5714303
26
2.9
26
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22
22
17
36
1.95
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27
3.5
27
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41
35
5
18
1.73
5721671--5721739
29
2.4
29
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4
15
1.67
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18
1.9
17
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32
20
0
47
1.51
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26
4.2
26
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0
175
33
6
24
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1.81
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26
2.6
26
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64
2
1
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18
1.9
17
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11
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27
0
0
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0.85
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5741325--5741362
19
2.0
19
85
10
51
55
0
7
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1.29
5743854--5743902
25
2.0
25
83
0
62
53
8
4
34
1.50
5745554--5745606
9
5.7
9
76
8
52
11
3
37
47
1.58
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26
2.3
26
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8
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5
0
40
1.23
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20
3.1
20
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11
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3
1
33
1.21
5754189--5754254
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2.1
32
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0
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26
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0
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27
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23
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5756318--5756431
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5760018--5760067
21
2.4
21
83
9
66
54
6
0
40
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427