Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  13  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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13
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0
25
0
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0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
23
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16
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59
42
0
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1.35
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15
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2.0
27
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2
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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16
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38
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
3
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1.15
3766368--3766419
16
3.4
16
75
20
65
36
0
3
59
1.16
3766370--3766423
17
3.4
17
70
19
62
37
0
3
59
1.15
3768369--3768395
5
5.4
5
100
0
54
0
18
0
81
0.69
3771965--3772028
3
21.0
3
96
3
119
67
0
0
32
0.91
3772124--3772157
3
11.0
3
93
6
59
64
0
0
35
0.94
3773741--3773840
44
2.2
45
85
1
130
26
28
13
33
1.93
3778884--3778953
25
2.9
24
81
6
79
12
25
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38
1.90
3779011--3779076
26
2.5
26
87
0
96
15
22
22
39
1.91
3782040--3782148
26
4.2
26
95
1
184
33
4
24
36
1.76
3783582--3783656
26
2.8
26
83
4
78
36
21
12
30
1.90
3783760--3783872
27
4.2
27
84
3
129
18
23
21
36
1.95
3783758--3783872
54
2.1
54
88
3
169
18
23
21
36
1.95
3793183--3793264
26
3.2
26
96
0
155
36
26
6
30
1.81
3797519--3797554
17
2.1
17
94
0
63
25
16
13
44
1.85
3798188--3798526
154
2.2
153
81
6
393
27
20
24
28
1.99
3798472--3798616
43
3.5
41
77
9
150
30
16
23
29
1.96
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23
2.1
23
88
0
71
22
0
28
48
1.50
3799408--3799454
16
2.8
17
80
6
51
21
2
27
48
1.61
3799423--3799461
7
5.3
7
82
11
51
20
0
28
51
1.48
3799621--3799759
7
19.3
7
67
5
53
25
1
34
38
1.65
3799693--3799766
29
2.6
28
73
14
69
25
1
33
39
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3799663--3799853
80
2.4
79
86
1
258
26
1
36
35
1.66
3799663--3799887
80
2.8
78
80
6
179
28
1
34
35
1.66
3800136--3800171
17
2.2
17
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5
65
22
0
5
72
1.05
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64
5.7
64
96
2
633
38
10
3
47
1.55
3803124--3803485
189
1.9
189
94
2
636
38
10
3
47
1.55
3804647--3804691
9
5.0
9
80
0
54
48
17
0
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1.48
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147
2.4
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2
379
37
14
22
25
1.92
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73
5.8
73
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38
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1.91
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6
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6
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7
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65
2
0
31
1.05
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3.2
64
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20
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29
25
18
26
1.98
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137
2.1
137
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0
547
31
24
18
24
1.98
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2.1
27
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6
67
24
14
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26
2.8
27
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4
82
27
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1.91
3811261--3811396
26
5.2
26
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1
220
36
23
5
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1.77
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24
2.2
24
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0
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7
25
1.45
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12
2.9
13
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15
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59
0
2
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1.12
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19
1.9
19
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2
0
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1.01
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19
2.0
20
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48
0
51
0
1.00
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2.0
15
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0
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23
26
0
1.50
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14
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30
17
23
28
1.97
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60
2.3
59
82
8
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28
19
25
26
1.99
3821981--3822024
22
2.0
22
90
0
70
50
36
0
13
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3821986--3822035
22
2.3
22
86
6
66
52
30
0
18
1.46
3822568--3822703
26
5.2
26
92
0
227
32
4
25
38
1.76
3824188--3824240
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
3828396--3828504
26
4.3
26
94
4
181
32
4
26
36
1.77
3829986--3830038
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
3832801--3832910
26
4.2
26
96
0
175
32
5
25
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3836131--3836214
26
3.2
26
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0
141
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23
4
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1.76
3841917--3841995
3
25.3
3
71
12
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1.9
20
94
0
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3
100
0
102
33
0
0
66
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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