Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  225  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63431348--63431405
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22
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0
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1.54
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0
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0
26
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2.5
25
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1.70
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32
2.7
32
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20
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201
24
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1.99
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79
2.1
79
80
6
183
26
19
27
26
1.99
63459590--63459713
43
2.9
43
80
7
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47
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17
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20
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1.28
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2.1
34
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10
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1
0
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1.09
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0
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100
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2.0
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25
2.00
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80
2.6
80
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4
247
25
22
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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3
7
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1.50
63498736--63498793
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6
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1.47
63498907--63498970
7
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10
83
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53
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9
115
45
31
0
22
1.58
63499060--63499315
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17.9
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127
45
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0
22
1.58
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2.4
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117
28
18
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31
1.97
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4.2
156
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19
29
1.97
63499917--63500007
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24
25
25
2.00
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19
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5
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2.0
33
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3.1
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16
27
27
1.97
63510594--63510702
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1.9
57
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25
1.97
63510594--63510695
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3.6
29
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1
125
26
16
30
26
1.97
63513429--63513463
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5.8
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18
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1.95
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2.0
22
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2.3
26
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0
95
34
4
19
40
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63520445--63520539
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24
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167
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20
29
1.99
63520744--63520848
47
2.2
48
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3
167
26
22
20
29
1.99
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20
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104
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1.82
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2.7
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83
2
209
39
7
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29
1.83
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304
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135
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23
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3.1
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22
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18
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1.90
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37
2.3
36
92
5
138
25
33
19
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63549560--63549649
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3.3
27
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69
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26
4
34
1.77
63549517--63550067
49
11.1
49
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2
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29
27
9
33
1.88
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3.8
46
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10
223
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21
28
28
1.98
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1.8
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0
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22
29
27
1.98
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2.5
23
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0
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21
21
21
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1.95
63560613--63560679
23
2.9
23
88
0
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19
22
23
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1.97
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16
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24
24
24
26
2.00
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0
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24
19
26
29
1.98
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29
2.5
28
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6
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27
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1.96
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29
2.1
29
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1.94
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1.97
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0
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2.00
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1.9
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25
26
22
25
2.00
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0
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1.99
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2.0
37
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1.98
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0
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2
0
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2.0
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0
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3
33
31
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7
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23
28
23
2.00
63597160--63597342
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23
27
24
2.00
63597210--63597375
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2.1
79
78
4
174
25
22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
23
1.98
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1.9
79
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2
252
22
31
21
23
1.98
63601499--63601649
39
3.9
39
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2
250
22
31
21
23
1.98
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39
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0
238
21
30
23
23
1.99
63609464--63609615
39
3.9
39
92
0
241
22
30
23
23
1.99
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2.8
27
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7.9
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1.82
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54
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273
29
22
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1.81
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27
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1.82
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1.84
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1.95
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2.00
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0
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26
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1.99
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2.00
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1.70
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23
76
20
70
50
22
5
22
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
63650843--63651001
43
3.7
43
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26
1.96
63650843--63651001
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1.9
85
84
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218
32
24
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26
1.96
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2.2
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26
26
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1.91
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1.93
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2.00
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15
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1.9
143
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0
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30
36
16
17
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427