Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  332  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96817804--96817854
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20
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0
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50
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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26
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2.0
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46
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220
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1.94
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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29
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29
26
1.99
Indices
Period
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Copy
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Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
60
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0
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146
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3
20
34
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97100038--97100135
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1.98
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1.98
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20
1.98
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175
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1.97
97111439--97111758
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2.4
132
88
1
451
26
24
17
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427