Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  419  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121799098--121799177
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2.5
31
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2.5
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2.1
19
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0
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2
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1.45
121835870--121835908
19
2.1
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0
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2.8
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18
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4
60
18
3
53
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2.0
42
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18
2
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4.7
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2.1
294
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356
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4
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20
1.61
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9
4.7
9
77
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2
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23
1.35
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0
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0
64
26
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70
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57
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1.54
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21
1.9
21
90
10
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25
2
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3.0
117
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18
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54
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1.61
121848228--121848262
3
11.7
3
87
0
52
2
2
65
28
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
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0
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9
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30
2.2
30
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7
91
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4
0
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121867576--121867623
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18
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31
2
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33
2.0
33
96
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8
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2.0
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0
0
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54
1.14
121900436--121900507
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2
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121900419--121900518
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2.2
29
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1
50
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1.9
29
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1
48
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100
0
72
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30
2.4
30
90
2
110
43
8
9
38
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121928875--121928908
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0
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18
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2.2
33
100
0
144
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0
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1
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0
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0
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31
0.99
121980624--121980676
22
2.5
21
79
8
63
58
0
3
37
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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29
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22
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3.8
49
79
15
200
28
28
20
21
1.98
121984971--121985142
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1.8
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93
1
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28
29
20
21
1.98
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4.9
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27
27
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1.98
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21
2.0
21
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0
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1.90
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2.0
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3
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19
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0
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28
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2.0
23
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0
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2
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2
2
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1.18
122041960--122042010
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1
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1.22
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2
5
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1.33
122045380--122045411
6
5.3
6
96
0
55
28
15
40
15
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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2.7
131
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126
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2.4
22
93
0
86
44
1
1
51
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122108174--122108211
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2.1
28
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0
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1.34
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0
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0
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0
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0
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7
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52
0
0
47
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427