Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  421  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122488645--122488686
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6.8
6
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0
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0
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0
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21
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62
33
0
5
61
1.18
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2.0
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2.6
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2.1
136
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17
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82
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67
24
14
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26
2.8
27
82
4
82
27
13
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36
1.91
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24
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1.69
122516477--122516586
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4.2
26
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0
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37
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1.78
122516477--122516517
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3.2
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22
50
41
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36
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2.0
40
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12
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2.4
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11
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51
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10
24
1.73
122542136--122542195
31
1.9
31
90
6
95
53
13
11
21
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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2.0
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0
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0
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0
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1.00
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24
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62
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40
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2.1
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100
0
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2.1
21
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0
0
30
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0
0
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9
18
36
36
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2.1
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2.0
46
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5
36
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1.9
29
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7
87
41
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16
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1.79
122587293--122587500
58
3.6
58
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22
13
12
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10
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22
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21
1
0
76
0.85
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9.9
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20
1
0
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0.85
122593788--122593867
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21
1
0
77
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20
1
0
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2.7
27
80
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20
1
0
78
0.83
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42
2.5
42
87
3
138
30
32
11
26
1.92
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118
2.0
118
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22
17
31
28
1.97
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1
47.0
1
84
0
58
91
2
4
2
0.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122602466--122602643
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89
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45
1.49
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1.9
30
89
7
89
40
7
8
43
1.63
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18
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77
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37
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1.33
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21
2.0
21
85
9
57
12
12
4
70
1.31
122618692--122618731
20
2.0
20
85
14
55
12
12
5
70
1.33
122621147--122621193
23
2.0
23
83
4
58
59
4
4
31
1.36
122621453--122621491
17
2.4
17
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61
5
0
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1.18
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35
0
0
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48
0
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48
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2
59
1.21
122701569--122701613
11
4.1
11
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4
0
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12
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12
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48
0
51
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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29
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1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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28
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0
1
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.16
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0
18
42
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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