Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  32  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8211184--8211475
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132
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0
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0
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132
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21
20
1.95
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21
21
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1.9
175
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4.4
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279
36
21
20
22
1.96
8241602--8241979
175
2.2
176
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4
390
37
21
19
22
1.95
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4.9
68
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2
449
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23
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1.99
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132
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17
24
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5.1
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0
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0
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20
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6
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16
38
10
36
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
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2.0
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1
0
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2
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22
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8295664--8295778
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2.1
54
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160
17
23
22
36
1.95
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39
2.3
39
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2.3
41
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125
25
26
20
28
1.99
8306281--8306401
40
3.0
39
80
4
109
18
22
22
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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112
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2.0
21
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0
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1.01
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2.4
17
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2
6
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1
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22
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18
63
36
1
1
60
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8362425--8362532
47
2.3
46
80
16
116
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0
1
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1
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17
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58
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17
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183
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47
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0
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12
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1.81
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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0
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
371
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0
0
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21
22
35
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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