Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  280  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80842609--80842792
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2.00
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1.94
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685
37
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1.92
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44
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0
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0
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2.4
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40
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26
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1.96
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2.5
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22
53
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0
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12
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0
0
68
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80895504--80895652
78
1.9
78
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2.0
21
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29
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0
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0
0
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28
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2.0
125
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24
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19
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19
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1.94
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1.94
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91
3
285
35
19
16
27
1.94
80928285--80928901
73
8.0
72
77
14
488
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19
16
31
1.94
80928122--80929065
157
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83
8
1110
33
19
16
31
1.93
80927554--80929065
477
3.2
476
83
10
1745
33
19
16
31
1.94
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317
3.2
311
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1450
32
19
16
31
1.94
80928834--80928997
90
1.8
89
92
3
276
32
18
16
31
1.94
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2.2
75
91
2
261
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18
17
30
1.94
80928759--80929071
165
1.9
164
86
4
448
31
18
15
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80939196--80939227
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2.0
17
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11
50
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6
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31
1.20
80946570--80946745
88
2.0
90
87
3
257
27
3
11
56
1.52
80949039--80949312
47
5.8
47
72
14
190
24
31
17
25
1.97
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49
4.7
48
77
12
203
25
31
17
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1.97
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1.8
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1.97
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25
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19
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15
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1.51
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Size
Copy
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Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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