Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  350  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101826743--101826783
9
4.6
9
82
11
57
48
17
9
24
1.76
101826801--101826841
6
6.5
6
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10
55
17
0
4
78
0.93
101826867--101826904
18
2.1
18
90
0
58
7
2
44
44
1.47
101828475--101828554
21
3.8
21
85
9
108
16
26
18
38
1.92
101828778--101828837
31
1.9
31
83
6
77
40
1
20
38
1.62
101829783--101829851
20
3.4
20
74
18
79
36
4
18
40
1.71
101829775--101829856
41
2.0
41
97
0
155
37
4
18
39
1.72
101831739--101831808
21
3.3
21
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7
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21
14
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101831718--101831896
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4.3
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1
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101831760--101831914
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3.7
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6
143
46
15
22
15
1.83
101832054--101832091
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2.3
17
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4
51
47
7
0
44
1.32
101836078--101836325
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2.7
92
75
5
232
36
24
13
25
1.92
101839017--101839060
20
2.2
20
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4
52
18
2
15
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1.41
101842032--101842194
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2.9
56
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1
229
25
16
26
31
1.96
101843164--101843195
15
2.1
15
94
0
55
21
0
21
56
1.43
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22
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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21
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15
39
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101856527--101856587
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2.0
31
93
0
104
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2
15.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.8
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35
2
5
56
1.35
101864080--101864138
30
1.9
30
82
3
73
47
3
22
27
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101865917--101865953
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7.2
5
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3
65
0
56
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0
0.99
101866055--101866113
21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
101866084--101866132
26
2.0
24
88
8
71
32
0
4
63
1.13
101866087--101866145
26
2.3
26
80
8
68
28
0
3
67
1.06
101879649--101879686
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2.0
20
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15
53
34
0
21
44
1.52
101880579--101880638
26
2.4
24
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8
75
68
3
0
28
1.05
101880609--101880667
21
2.8
22
85
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70
69
6
0
23
1.12
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2.2
25
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0
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26
28
14
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1.95
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18
2.2
18
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51
15
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33
17
1.92
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3
80
0
54
40
2
0
57
1.11
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17
1.9
18
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52
41
0
23
35
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21
2.8
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19
22
21
36
1.95
101891674--101891730
15
3.6
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76
11
55
64
0
29
5
1.15
101898157--101898247
33
2.8
33
91
0
146
16
32
27
23
1.96
101898798--101898857
21
3.0
20
76
16
61
68
0
28
3
1.05
101901951--101902014
30
2.1
30
100
0
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26
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23
43
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101906728--101906756
14
2.1
14
100
0
58
0
34
6
58
1.25
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18
2.2
18
86
9
53
68
2
7
21
1.28
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26
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26
97
0
177
36
25
5
32
1.80
101921636--101921690
24
2.4
23
81
6
67
54
7
1
36
1.39
101922032--101922091
30
2.0
31
87
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88
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5
5
23
1.31
101922289--101922374
3
29.0
3
90
6
140
66
1
0
32
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101927440--101927498
30
2.0
30
96
0
109
32
8
13
45
1.74
101931814--101931878
34
1.9
34
93
0
112
18
18
47
15
1.82
101932299--101932331
17
2.0
17
94
5
59
60
0
3
36
1.12
101936180--101936220
18
2.3
18
83
4
57
17
29
39
14
1.89
101937691--101937756
32
2.1
32
97
0
123
37
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9
36
1.81
101953716--101953747
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100
0
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31
0
0
68
0.90
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2.0
17
88
5
50
42
0
21
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1.53
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1.9
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13
11
36
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100
0
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0
0
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1.00
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1.92
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100
0
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0
0
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0.93
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65
1
1
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1.13
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9
80
8
56
68
1
1
27
1.10
101973164--101973233
28
2.4
29
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1
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0
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0
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1.19
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46
3.7
46
78
13
208
28
30
21
19
1.98
102020242--102020451
93
2.3
93
92
0
339
28
28
20
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102020289--102020461
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3.7
47
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13
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28
28
19
23
1.98
102042134--102042245
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2.9
38
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0
161
38
20
11
29
1.88
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3
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3
100
0
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0
0
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2.0
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25
20
23
31
1.98
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2.0
103
98
0
396
30
23
14
31
1.95
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38
2.4
38
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5
125
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18
10
34
1.85
102051419--102051513
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2.0
47
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45
3
1
50
1.24
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2.0
25
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2
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0
0
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1.11
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0
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0
0
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0
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25
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2
199
35
12
22
29
1.91
102082753--102082933
65
2.8
65
78
7
213
35
12
21
30
1.90
102082754--102082962
98
2.1
99
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235
35
12
22
28
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102084044--102084174
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2.0
66
100
0
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23
2.1
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2
2
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1.24
102085626--102085695
37
1.9
36
85
8
97
54
2
1
41
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102087960--102088630
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2.0
342
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2
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15
14
35
1.88
102088826--102088855
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1.9
15
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13
0
3
83
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2.2
16
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2
2
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1.30
102089245--102089295
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2.0
26
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1
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2.0
26
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28
1.48
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0
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0
35
1.12
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11
4.5
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2
0
40
1.10
102095442--102095481
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2.8
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0
0
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0.98
102095441--102095490
9
5.7
9
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2
0
40
1.10
102095428--102095490
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2
75
12
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3
0
38
1.14
102095570--102095615
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2.0
23
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2
36
1.31
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2
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1.38
102097442--102097616
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2.0
89
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20
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1.97
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2.1
17
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23
7
2
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1.32
102102592--102102632
19
2.3
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4
2
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1.30
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0
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0
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1.00
102107986--102108015
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100
0
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0
0
50
1.00
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0
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0
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0.76
102109857--102109917
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2.2
27
83
13
72
1
24
0
73
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102111410--102111461
25
2.1
25
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42
15
7
34
1.75
102116691--102116754
31
2.0
32
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20
17
14
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1.81
102118445--102118530
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2.0
43
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0
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1.88
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2.0
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0
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2
2
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1.07
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3.4
208
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2
1132
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1.97
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2.0
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1.93
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0
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102145467--102145506
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2.0
20
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1.54
102145458--102145507
11
4.8
10
83
16
66
30
26
0
44
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427