Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  420  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122162144--122162179
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2
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0
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0
0
50
1.00
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0
0
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1.00
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2.0
18
100
0
72
27
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1.88
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15
2.7
15
82
14
50
28
2
0
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1.01
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2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
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2.0
20
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42
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50
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2.0
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50
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6
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1.20
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3.1
11
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61
17
0
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45
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144
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20
16
30
1.95
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80
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71
15
282
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20
16
31
1.95
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2.0
85
87
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73
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1.95
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2.0
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30
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18
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1.98
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4.1
73
85
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399
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2.0
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0
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28
2
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2.0
104
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0
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35
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24
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10
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58
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0
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1.30
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2.7
24
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19
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58
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2
29
1.44
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2.0
16
93
0
55
12
6
40
40
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
26
1.84
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52
1.9
52
85
4
139
30
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14
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2.0
71
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0
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23
13
31
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1
100
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100
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0
0
0.00
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160
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0
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16
20
32
1.95
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1.9
71
90
0
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30
16
23
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1.96
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1.9
70
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1
205
31
16
23
29
1.96
122211542--122211675
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1.9
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1
196
32
16
22
29
1.96
122211702--122211835
71
1.9
70
87
1
196
32
16
22
29
1.96
122211862--122212038
71
2.5
71
80
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207
32
14
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32
1.93
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290
28
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15
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1.87
122214056--122214115
11
5.2
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33
3
3
60
1.30
122214057--122214120
25
2.6
25
76
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69
34
3
3
59
1.29
122214149--122214190
23
1.9
23
85
9
61
35
9
2
52
1.47
122215603--122215641
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
122215881--122215991
38
2.8
40
72
5
100
23
19
27
29
1.98
122216138--122216178
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
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2.7
29
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11
81
62
2
6
29
1.33
122218095--122218142
24
2.0
24
84
4
62
75
0
10
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1.06
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14
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28
1.95
122228604--122228670
24
2.8
24
95
0
116
19
17
28
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122231703--122231831
44
2.8
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34
13
24
27
1.93
122238085--122238130
22
2.1
22
84
8
58
52
2
2
43
1.25
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20
2.2
20
88
4
63
31
0
2
65
1.05
122238716--122238757
19
2.2
19
83
8
50
30
0
2
66
1.04
122246390--122246443
26
2.1
27
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69
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1
1
38
1.20
122248641--122248677
18
2.1
18
100
0
74
18
16
16
48
1.81
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19
2.7
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55
62
0
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2
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53
48
0
3
48
1.17
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2.7
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7
80
29
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15
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22
30
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24
21
29
24
1.99
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21
29
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21
29
24
1.99
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40
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1.9
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55
3
5
35
1.38
122318353--122318386
2
17.0
2
93
0
59
50
2
0
47
1.16
122329199--122329237
20
1.9
20
84
5
51
10
7
5
76
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16.1
18
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37
15
11
35
1.84
122333559--122333762
54
3.8
54
75
7
191
37
15
12
35
1.85
122333561--122333762
72
2.8
71
79
8
212
37
15
11
35
1.84
122333936--122334060
45
2.8
45
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1
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17
17
1.88
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0
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0
0
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0
0
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1.83
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122339851--122340052
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203
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26
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1.80
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0
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0
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0
0
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122355283--122355368
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2
0
38
1.10
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203
29
29
20
21
1.98
122357991--122358161
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1.8
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93
1
297
28
29
21
21
1.98
122365268--122365318
4
13.5
4
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1
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21
1.11
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1.9
18
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122369705--122369765
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2.5
24
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10
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42
3
1
52
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122373748--122373791
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2.0
21
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2
2
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1.25
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0
0
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0
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1.13
122384946--122385006
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0
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0
0
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15
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24
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0
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2.1
18
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0
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5
10
57
26
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122449135--122449186
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1.9
27
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1.64
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0
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1.66
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1.9
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0
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1.08
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0
0
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90
0
57
0
15
12
72
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427