Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  84  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21729231--21729300
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2.6
27
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1.96
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1.97
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21
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1.99
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240
29
28
17
24
1.97
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2.0
30
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56
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169
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13
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1.94
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0
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2.0
30
100
0
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20
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90
0
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22
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3.2
80
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331
22
22
28
26
1.99
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2.8
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80
3
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29
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18
1.93
21783210--21783310
29
3.5
28
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10
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26
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20
1.95
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3.5
28
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7
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27
34
17
20
1.95
21795716--21795944
40
5.8
40
89
2
329
21
22
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21795716--21795970
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3.2
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4
331
22
22
28
26
1.99
21795716--21795970
40
6.5
40
87
3
322
22
22
28
26
1.99
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175
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0
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2
118
21
16
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305
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28
24
25
1.99
21819212--21819293
29
2.8
29
98
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29
14
30
25
1.95
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26
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1.97
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16
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100
0
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0
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1.39
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13
2.7
15
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100
0
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147
26
33
19
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49
94
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480
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28
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1.87
21853716--21854026
146
2.1
147
90
1
498
30
28
8
32
1.87
21857864--21858085
79
2.8
80
93
2
369
26
29
21
23
1.99
21857864--21858085
119
1.9
118
91
2
365
26
29
21
23
1.99
21857864--21858085
40
5.6
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2
369
26
29
21
23
1.99
21857890--21858202
40
7.9
39
86
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287
27
28
19
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21857881--21858199
119
2.7
119
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328
27
29
19
23
1.98
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2.3
36
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5
147
26
33
19
20
1.97
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49
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30
29
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31
1.87
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1.9
197
89
1
576
29
29
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1.88
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9
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0
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22
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105
28
28
15
26
1.96
21871914--21871940
9
3.0
9
100
0
54
22
22
0
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1.44
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2.4
77
95
0
333
24
22
31
21
1.98
21893991--21894179
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4.9
39
94
3
319
24
22
31
21
1.98
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21
27
25
2.00
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21
27
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2.00
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50
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18
22
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1.96
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1.99
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27
14
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21
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1.99
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100
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324
26
19
26
28
1.99
21922945--21923132
49
3.8
49
81
6
236
27
18
26
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21923977--21924038
30
2.1
30
100
0
124
30
9
9
50
1.67
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28
3.5
29
93
6
159
32
27
12
27
1.92
21939108--21939205
28
3.5
29
93
6
159
32
27
12
27
1.92
21944227--21944489
46
5.7
46
77
7
243
23
26
20
29
1.99
21944230--21944489
139
1.9
136
82
10
323
23
26
20
29
1.99
21952168--21952219
26
2.0
26
88
0
77
30
9
19
40
1.83
21963312--21963350
21
1.9
20
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5
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30
0
23
46
1.53
21984676--21984884
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53
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24
16
37
1.93
21986950--21987047
28
3.5
28
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4
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29
16
24
29
1.96
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29
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29
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5
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25
16
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25
1.96
21999259--21999384
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2.2
58
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2
139
27
15
32
23
1.95
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40
4.4
40
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3
198
26
24
25
24
2.00
22000928--22001106
80
2.2
81
85
3
236
26
24
25
24
2.00
22001049--22001132
40
2.1
40
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4
98
26
27
26
20
1.99
22000962--22001132
80
2.1
80
81
4
193
28
24
24
22
2.00
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2.1
16
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0
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2.2
49
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6
132
30
19
26
23
1.98
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21
2.9
19
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7
59
14
40
22
21
1.90
22011259--22011300
22
1.9
22
90
0
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0
2
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1.10
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6
5.5
6
100
0
66
18
18
15
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18
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18
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0
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33
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1.77
22027419--22027452
6
5.7
6
85
0
50
20
17
14
47
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22027594--22027646
18
2.9
18
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0
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35
7
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1.78
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39
1.9
39
83
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5
1
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1.33
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3
100
0
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0
0
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0.92
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21
2.5
21
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0
12
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21
2.3
23
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0
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0
58
1.23
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1.96
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0
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0
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43
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27
26
1.99
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2.3
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223
24
21
27
26
2.00
22082528--22082692
79
2.1
79
80
6
183
26
20
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22087301--22087358
21
2.8
20
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3
25
1.22
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7
24
1.66
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2.7
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0
5
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0.96
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1.98
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255
2.0
255
98
0
1005
22
16
21
38
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427