Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  4  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
976452--976588
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3
0
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0
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12
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5
0
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1.24
982093--982126
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2.0
17
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0
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20
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986434--986478
2
22.5
2
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0
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19
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1.81
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12
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14
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0
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46
36
0
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1.47
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2.0
23
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10
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36
1.65
1004315--1004359
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
1006165--1006293
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2.8
45
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1.93
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44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
1021859--1021896
15
2.6
14
84
15
51
36
2
2
57
1.26
1022664--1022732
5
13.4
5
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10
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37
4
2
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2.3
24
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16
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64
1
0
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1.04
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4.7
6
100
0
56
35
35
14
14
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
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2
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10
10
50
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3.7
19
72
7
59
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1
5
45
1.36
1029561--1029627
25
2.5
28
72
18
70
50
1
1
46
1.19
1031863--1032145
92
3.0
94
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3
419
47
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14
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2.1
19
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20
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1
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2.0
99
98
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19
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1.9
84
92
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2.1
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1.54
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22
2.2
22
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53
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6
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2.1
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0
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2.0
22
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15
10
38
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2.5
12
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51
0
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2.0
184
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19
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1.9
31
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10
86
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10
13
30
1.76
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22
2.5
22
84
3
63
69
1
1
26
1.09
1062828--1062870
13
3.3
13
81
15
54
69
2
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1.00
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2.0
186
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1
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16
19
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1.89
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20
2.4
19
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13
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54
2
4
39
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2.0
26
81
14
61
48
0
4
48
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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2.0
68
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22
1.77
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0
50
0
1.00
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37
0
0
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4.2
23
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115
9
4
52
34
1.53
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1.80
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1.9
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100
0
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16
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1.31
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4.2
160
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1.9
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23
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1.9
71
88
0
205
29
22
16
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1.96
1095418--1095470
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3.5
15
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2
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18
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1.80
1096322--1096373
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25
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0
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2
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0
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6
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1.79
1122153--1122189
18
2.1
18
89
0
56
54
2
0
43
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1123413--1123468
21
2.7
21
91
0
94
25
8
37
28
1.86
1126528--1127461
465
2.0
465
95
0
1679
32
17
23
26
1.96
1127510--1127564
26
2.1
27
86
3
76
25
9
25
40
1.85
1127597--1127660
29
2.2
29
86
5
85
21
4
20
53
1.64
1128880--1128947
34
2.0
34
94
5
120
39
29
8
22
1.84
1129126--1129158
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
1129773--1129827
19
2.9
19
75
5
58
40
7
1
50
1.40
1132373--1132411
18
2.2
18
100
0
78
28
5
7
58
1.47
1134576--1134608
2
16.5
2
93
0
57
48
0
3
48
1.17
1138215--1138267
21
2.5
21
87
6
72
11
26
26
35
1.90
1138852--1139257
208
2.0
208
85
2
546
50
16
12
19
1.77
1147677--1147861
102
1.8
102
86
2
273
40
11
12
35
1.80
1148967--1149039
31
2.4
29
78
13
76
64
6
1
27
1.27
1149423--1149448
12
2.2
12
100
0
52
84
7
0
7
0.77
1158610--1158649
16
2.4
18
80
12
50
57
7
0
35
1.27
1161428--1161454
13
2.1
13
100
0
54
22
0
29
48
1.51
1162086--1162118
17
2.1
16
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11
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30
0
0
69
0.88
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26
2.0
24
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7
73
30
0
6
64
1.18
1164961--1164987
6
4.5
6
100
0
54
33
0
51
14
1.43
1168294--1168324
14
2.2
14
100
0
62
41
9
12
35
1.76
1175278--1175318
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
1178821--1178860
15
2.7
15
85
11
55
40
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1179790--1179829
20
2.0
20
95
0
71
27
35
7
30
1.84
1192656--1192691
9
3.9
9
92
3
54
27
0
0
72
0.85
1195791--1195816
8
3.2
8
100
0
52
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0
11
0
0.52
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13
2.0
13
100
0
52
30
23
7
38
1.83
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23
2.7
22
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13
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54
0
1
43
1.09
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18
4.2
18
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0
114
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14
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1.95
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17
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17
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4
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70
1
5
22
1.17
1235739--1236064
130
2.5
130
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30
20
18
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1.96
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26
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0
90
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0
0
38
0.96
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10
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71
0
3
25
1.03
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51
2.3
51
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3
142
32
16
9
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1.81
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72
1.9
72
92
3
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33
12
27
26
1.92
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24
2.0
23
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4
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0
0
31
0.90
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49
6.9
49
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13
279
21
25
17
35
1.95
1253278--1253635
53
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9
359
21
25
17
35
1.95
1253281--1253634
102
3.4
102
86
6
467
22
25
17
35
1.95
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58
2.2
58
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2
153
44
15
4
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1.65
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26
1.9
24
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8
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64
6
0
29
1.18
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20
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7
57
63
1
0
35
1.05
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17
2.0
17
100
0
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11
17
35
1.87
1271132--1271162
5
6.2
5
100
0
62
19
0
0
80
0.71
1271634--1271672
17
2.4
16
86
4
51
48
0
2
48
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1272361--1272392
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
1274284--1274322
16
2.5
16
83
4
53
33
0
0
66
0.92
1275004--1275037
16
2.1
16
88
0
50
44
8
11
35
1.72
1275917--1276102
89
2.1
88
81
6
214
41
10
6
40
1.65
1283135--1283204
20
3.5
19
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7
68
47
5
2
44
1.41
1287096--1287134
21
1.9
20
89
5
60
48
0
2
48
1.15
1287093--1287135
9
4.4
9
78
16
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44
0
2
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1.13
1287093--1287157
30
2.2
30
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0
76
41
4
6
47
1.49
1287843--1287871
12
2.5
12
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27
6
6
58
1.50
1287959--1287997
19
2.0
20
95
5
71
17
0
10
71
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427