Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  371  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107652524--107652752
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38
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1
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32
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20
20
1.97
107660055--107660205
38
4.0
39
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5
204
31
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21
19
1.98
107666567--107666690
39
3.2
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3
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29
22
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1.99
107674493--107674669
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4.4
40
85
4
234
25
27
22
23
2.00
107677667--107677745
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2.1
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0
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30
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17
24
1.97
107677770--107677962
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3.4
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2
316
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24
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107684780--107684970
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3.4
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1
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0
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0
0
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66
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5
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20
27
1.92
107722553--107722670
22
5.4
22
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2
139
14
32
21
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4.6
35
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185
33
23
10
32
1.89
107728176--107728348
75
2.4
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83
9
210
33
23
10
32
1.89
107735680--107735847
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
107735675--107735847
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
107740770--107740846
31
2.5
31
100
0
154
36
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22
27
1.92
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15
115
33
2
3
60
1.28
107744863--107744892
15
2.0
15
93
0
51
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0
3
23
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
24
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3
1
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15
2.3
15
89
0
50
29
0
2
67
1.05
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27
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28
88
5
175
34
22
25
17
1.96
107756649--107756685
8
4.6
8
89
0
56
5
24
18
51
1.67
107757859--107757994
26
5.2
26
94
0
236
36
25
5
33
1.78
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5
5.8
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0
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0
0
17
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26
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2.5
45
84
0
165
33
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23
27
1.95
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23
4.5
24
68
26
68
30
5
0
62
1.24
107769466--107769500
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2.3
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28
0
0
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1.99
107777311--107777338
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2.2
13
100
0
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57
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0
28
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2.3
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6
176
44
0
5
50
1.24
107785089--107785135
24
2.0
24
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69
36
6
10
46
1.64
107786535--107786642
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2.1
51
91
0
171
41
12
19
25
1.87
107787468--107787695
46
5.0
46
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2
298
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14
22
21
1.88
107787464--107787695
92
2.5
92
88
1
331
42
13
22
21
1.88
107794871--107794905
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3.2
11
91
0
61
74
0
0
25
0.82
107795668--107795805
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2.0
69
98
0
267
36
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18
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1.89
107795988--107796054
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4.9
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1
11
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1.50
107795980--107796062
41
2.0
41
100
0
166
45
2
12
39
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107796257--107796321
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10.8
6
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12
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18
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3
75
1.07
107796259--107796296
17
2.2
17
86
9
51
21
0
2
76
0.91
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15.8
6
94
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156
16
0
1
82
0.72
107801899--107801983
1
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1
69
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15
0
0
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1.9
30
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12
1.87
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23
2.2
23
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47
11
29
11
1.76
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0
0
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14
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19
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0
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23
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13
8
37
1.76
107877437--107877524
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1.9
46
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0
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27
29
22
20
1.99
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45
2.7
45
97
1
228
28
30
22
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.6
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7
201
33
24
10
31
1.90
107898856--107899027
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2.4
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8
226
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23
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1.90
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36
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2
28
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0
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20
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1
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0
0
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107948359--107948424
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28
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0
1
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3
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35
8
0
56
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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0
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2.2
25
86
6
74
18
31
16
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108012849--108012899
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22
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1
1
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1.23
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2.0
20
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0
2
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1.13
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19
2.1
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0
0
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0.99
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1.97
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0
0
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2.5
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0
0
30
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427