Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  241  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68363470--68363541
30
2.4
30
88
4
110
25
25
6
43
1.79
68365833--68365908
20
3.8
20
76
0
71
21
21
18
39
1.93
68372777--68372833
19
2.8
22
67
22
52
35
1
0
63
1.05
68372897--68372942
24
2.0
24
86
4
67
28
0
6
65
1.17
68372871--68372953
21
3.8
22
74
14
66
24
0
6
69
1.10
68374551--68374594
12
3.7
12
87
0
61
25
31
29
13
1.94
68374555--68374589
18
1.9
18
94
0
61
25
34
28
11
1.91
68374552--68374594
6
7.2
6
86
0
50
25
32
27
13
1.94
68375991--68376016
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
68379580--68379625
18
2.4
20
82
10
60
4
17
0
78
0.91
68381391--68381554
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
68381391--68381588
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
68383392--68383575
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
68383432--68383620
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
68389575--68389607
18
1.9
17
88
11
50
36
12
21
30
1.90
68393751--68393790
20
2.0
20
85
0
53
30
22
22
25
1.99
68396444--68396635
95
2.0
95
98
0
375
27
23
24
24
2.00
68398913--68398944
16
2.0
16
93
0
55
34
18
0
46
1.49
68399155--68399532
50
7.5
50
74
9
313
30
24
17
28
1.97
68399149--68399539
151
2.6
151
90
0
622
29
24
17
27
1.97
68399153--68399533
101
3.8
100
75
9
265
30
24
17
27
1.97
68399886--68399932
19
2.3
20
82
10
60
48
14
0
36
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68401488--68401596
43
2.5
43
85
4
139
34
22
15
26
1.94
68406924--68407072
57
2.6
56
80
9
167
32
17
18
32
1.94
68409327--68409484
44
3.7
42
81
7
185
31
25
18
24
1.98
68412823--68412862
18
2.2
18
86
8
55
30
12
22
35
1.91
68417415--68417528
46
2.5
44
81
11
124
30
16
28
24
1.97
68417592--68417766
49
3.6
50
75
8
137
25
19
28
26
1.99
68425748--68425861
43
2.7
43
89
5
169
30
21
18
28
1.97
68429151--68429194
17
2.4
18
88
7
63
25
38
20
15
1.92
68440047--68440095
24
2.0
24
84
11
64
51
12
0
36
1.40
68454120--68454169
20
2.5
20
86
0
73
22
8
18
52
1.71
68456082--68456133
7
7.4
7
86
0
59
21
46
1
30
1.62
68456080--68456134
28
2.0
28
89
7
85
21
43
3
30
1.70
68458576--68458885
125
2.5
125
91
1
514
37
16
17
29
1.91
68469944--68469996
11
4.9
11
79
4
54
33
0
1
64
1.05
68475301--68475330
9
3.4
9
90
9
53
63
0
0
36
0.95
68475443--68475476
17
2.0
17
100
0
68
64
0
0
35
0.94
68475583--68475637
21
2.6
22
85
8
78
9
21
43
25
1.82
68475780--68475821
18
2.3
18
91
0
66
42
7
28
21
1.79
68475876--68475943
30
2.3
30
87
5
102
8
20
42
27
1.82
68477675--68477715
2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
68478645--68478684
20
1.9
22
85
10
57
37
2
0
60
1.11
68480523--68480552
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68481001--68481033
17
1.9
17
93
0
57
81
0
18
0
0.68
68482670--68482709
21
1.9
21
89
0
62
32
25
15
27
1.95
68486047--68486122
40
1.9
40
88
0
116
35
36
14
13
1.85
68489321--68489355
14
2.5
14
90
0
52
34
2
0
62
1.10
68490115--68490155
17
2.4
17
83
0
55
63
14
4
17
1.47
68493469--68493550
26
3.2
26
96
0
155
30
7
28
34
1.84
68500619--68500750
29
4.6
29
88
0
165
29
15
31
24
1.95
68508433--68508564
29
4.6
29
88
0
165
29
15
31
24
1.95
68510013--68510534
180
2.9
177
88
2
724
27
23
17
31
1.97
68511066--68511468
177
2.3
176
82
5
478
28
25
16
30
1.96
68511434--68511536
45
2.3
44
79
11
120
31
26
17
25
1.97
68511196--68511535
176
1.9
175
82
5
427
29
25
17
28
1.97
68510704--68511515
442
1.8
442
85
2
1148
28
24
16
30
1.96
68511718--68511907
66
2.9
66
87
3
285
38
12
17
31
1.87
68512983--68513026
8
5.2
8
78
10
52
4
9
2
84
0.85
68512974--68513026
26
2.1
26
86
6
74
7
7
5
79
1.06
68523500--68523564
3
21.7
3
100
0
130
66
0
33
0
0.92
68525432--68525478
21
2.2
21
77
7
51
46
17
2
34
1.59
68531097--68531231
48
2.8
48
72
10
123
31
17
17
34
1.92
68533663--68533798
48
2.8
48
86
2
193
30
17
18
33
1.94
68536185--68536215
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
68540198--68540244
24
2.0
24
95
0
85
25
8
14
51
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68542259--68542299
2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
68543822--68543934
40
2.8
39
85
2
136
24
29
23
23
1.99
68549732--68549832
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
68549732--68549914
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
68558616--68558690
29
2.5
29
86
4
78
24
30
16
29
1.96
68559853--68559906
21
2.8
20
81
10
58
5
14
1
77
1.03
68561420--68561578
43
3.7
43
85
5
198
29
29
16
24
1.96
68564629--68564673
21
2.1
21
84
8
56
37
4
6
51
1.49
68565987--68566041
28
2.0
28
96
0
101
29
25
16
29
1.97
68566006--68566078
34
2.1
34
82
9
87
31
21
19
27
1.97
68574714--68574751
20
1.9
20
94
0
67
63
0
13
23
1.30
68576297--68576483
40
4.7
40
85
0
221
21
32
13
32
1.93
68576297--68576484
80
2.3
80
87
0
250
21
31
14
32
1.93
68578293--68578407
43
2.6
44
80
9
146
27
18
24
29
1.98
68582549--68582637
28
3.0
28
88
9
115
24
21
22
31
1.98
68582549--68582651
34
3.2
32
79
17
117
24
20
24
31
1.98
68584554--68584599
23
2.0
23
100
0
92
13
21
34
30
1.91
68586117--68586150
16
2.1
16
88
0
50
11
29
17
41
1.85
68593241--68593389
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
68593282--68593389
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
68601353--68601501
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
68601394--68601501
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68609112--68609296
39
4.8
39
81
4
160
25
23
25
24
2.00
68609118--68609302
75
2.4
75
83
7
221
24
24
25
24
2.00
68609157--68609316
39
4.2
38
82
9
184
22
25
28
24
2.00
68617104--68617204
40
2.5
40
83
1
123
29
22
23
23
1.99
68617145--68617296
40
3.8
40
85
5
182
26
24
26
22
2.00
68617141--68617312
81
2.1
80
83
4
229
25
22
26
25
2.00
68633806--68634156
175
2.0
175
98
0
675
26
20
22
30
1.98
68639489--68639531
18
2.4
18
84
7
52
25
27
0
46
1.53
68640498--68640529
15
2.0
17
88
11
50
43
31
0
25
1.55
68657965--68658039
37
2.1
37
87
12
111
29
33
10
26
1.90
68659814--68659849
17
2.2
16
90
5
54
66
0
25
8
1.19
68664097--68664277
55
3.4
53
78
8
195
21
23
19
35
1.96
68664078--68664285
54
3.9
54
79
6
206
22
23
18
36
1.95
68668070--68668113
18
2.4
18
85
11
54
65
0
11
22
1.24
68668815--68668856
18
2.3
18
84
8
50
71
0
4
23
1.05
68676061--68676108
18
2.7
18
81
9
53
70
0
8
20
1.12
68676078--68676107
13
2.2
14
94
5
53
80
0
6
13
0.91
68680703--68680879
48
3.8
47
75
12
186
24
19
26
29
1.99
68680704--68680872
91
1.9
90
86
3
241
24
19
26
28
1.99
68700481--68700540
23
2.6
23
89
2
93
28
8
13
50
1.70
68701056--68701093
20
1.9
20
88
0
58
50
7
7
34
1.61
68701973--68702019
24
2.0
24
95
0
85
38
0
36
25
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68706684--68706791
39
2.7
39
83
12
132
24
25
28
21
1.99
68714753--68714936
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
68714793--68714981
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
68715076--68715105
15
2.0
15
100
0
60
46
13
26
13
1.80
68721164--68721221
20
3.0
20
92
7
102
36
10
20
32
1.87
68721270--68721388
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
68721270--68721388
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
68721576--68721640
31
2.1
31
94
0
112
38
15
23
23
1.92
68732044--68732091
25
1.9
25
91
0
78
35
25
14
25
1.94
68732135--68732193
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427