Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  411  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119504701--119504872
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3.7
46
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1
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21
23
13
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119507009--119507060
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63
3
0
32
1.12
119509790--119509850
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80
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77
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0
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2.1
18
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5
56
25
0
19
55
1.43
119527103--119527148
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2.1
22
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17
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0
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0
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0
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30
6
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61
1.32
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21
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5
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2
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0
0
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1.00
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3
22
41
1.70
119563563--119563625
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22
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1.70
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2.5
29
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6
20
18
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1.64
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3.4
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7
55
1.37
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15
2.1
14
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5
53
35
3
6
54
1.42
119571929--119571961
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50
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15
12
0
1.12
119574136--119574247
16
6.9
16
68
11
75
22
8
33
34
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119574118--119574247
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23
9
33
33
1.86
119578119--119578166
20
2.5
19
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6
60
52
0
4
43
1.20
119578254--119578294
20
2.0
20
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0
73
43
14
12
29
1.82
119580129--119580187
23
2.6
22
70
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55
55
1
0
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1.09
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30
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0
42
1.18
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2.7
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22.8
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18
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2
24
4
69
1.18
119595233--119595316
24
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76
15
82
1
26
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69
1.12
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0
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0
0
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0
0
38
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4
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1.32
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2.6
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0
51
53
2
0
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2.2
20
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0
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58
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2.9
130
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5
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18
17
34
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2.1
101
83
10
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6
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1.40
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2.2
16
95
0
63
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0
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2.0
21
90
0
64
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21
29
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1.98
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13
196
28
29
21
20
1.98
119616301--119616471
93
1.8
93
92
0
288
28
29
21
20
1.98
119619831--119619991
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184
24
31
20
23
1.98
119619874--119620036
46
3.6
43
82
6
166
22
32
19
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119622561--119622735
46
3.8
46
76
13
187
27
30
21
21
1.98
119622569--119622739
93
1.8
93
91
2
281
26
30
21
21
1.98
119629616--119629649
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3.0
12
91
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52
0
0
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2.1
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0
0
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70
23
0
6
69
1.12
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2.0
24
88
8
71
32
0
4
63
1.13
119632939--119632997
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2.3
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0
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1.00
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0
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5
59
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Period
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Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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1.94
119696890--119697478
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2.7
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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(0-2)
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0
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0.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427