Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  240  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68055253--68055393
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5.2
26
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6
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17
22
24
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1.95
68055253--68055393
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2.6
53
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2
219
17
22
24
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1.95
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18
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0
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0
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116
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22
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1.90
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48
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28
18
28
23
1.98
68071882--68072403
144
3.6
144
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611
28
18
28
24
1.98
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2.8
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0
231
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29
28
1.98
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4.6
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11
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3.0
30
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3.8
46
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10
232
20
21
29
28
1.98
68084434--68084605
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1.8
93
96
0
317
20
22
30
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1.98
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2.5
17
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17
61
67
0
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18
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12
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60
68
0
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18
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17
2.2
17
95
0
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65
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1.26
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2.2
26
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0
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41
10
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1.83
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2
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19
2.3
19
95
0
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30
13
32
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1.93
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2.8
45
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5
150
21
29
20
27
1.98
68143715--68143755
22
1.9
21
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5
55
9
34
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26
1.88
68151981--68152101
25
4.8
25
72
17
99
24
23
20
30
1.99
68151968--68152049
24
3.4
24
77
15
96
23
25
21
29
1.99
68151968--68152101
49
2.7
49
87
2
169
24
24
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68159775--68159907
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49
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3
151
26
22
20
30
1.98
68159775--68159902
25
5.2
24
70
11
89
25
22
21
30
1.99
68170885--68170941
21
2.6
22
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5
71
17
31
35
15
1.92
68171994--68172022
14
2.1
14
100
0
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2.2
20
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1.57
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43
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30
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20
1.93
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17
1.9
17
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21
18
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14
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14
2.1
14
100
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31
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34
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22
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27
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16
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0
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72
57
0
0
42
0.98
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15
2.0
15
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0
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53
16
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1.44
68196586--68196756
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2.0
85
96
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315
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18
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36
1.67
68198562--68198605
22
2.0
22
100
0
88
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18
27
22
1.97
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4.2
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26
22
26
2.00
68209509--68209736
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4.6
49
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29
27
17
25
1.98
68209496--68209733
99
2.4
100
85
2
300
29
26
18
25
1.98
68209496--68209741
101
2.5
99
84
2
323
28
27
18
25
1.98
68217765--68217847
25
3.3
24
84
5
94
27
46
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19
1.73
68218306--68218369
29
2.1
31
83
11
80
35
0
3
60
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68218347--68218371
8
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0
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0
0
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0.80
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1.9
22
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5
57
31
24
4
39
1.76
68223300--68223404
40
2.6
40
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10
106
29
25
21
22
1.99
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25
1.9
25
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0
69
31
22
16
29
1.96
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26
2.8
26
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110
23
26
22
27
1.99
68226071--68226156
26
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25
84
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104
26
24
22
26
2.00
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31
2.7
31
92
1
134
32
17
26
23
1.97
68230968--68230997
14
2.1
14
100
0
60
30
10
33
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21
1.9
22
85
5
57
31
24
4
39
1.76
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2.8
40
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15
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26
20
22
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0
2
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1.13
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17
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17
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50
47
2
0
50
1.14
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1.9
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14
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1.91
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0
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15
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23
28
24
24
1.99
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78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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46
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1.78
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0
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27
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205
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21
17
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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133
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1.96
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1.96
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2.0
20
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0
2
69
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68333591--68333647
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0
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1.99
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1.99
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1.99
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2.5
28
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10
92
31
22
13
31
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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