Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  397  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115070523--115070567
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2.1
22
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0
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0
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1.20
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0
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2.3
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2.0
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210
33
23
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32
1.89
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35
4.6
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192
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24
10
31
1.90
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11
221
33
23
10
31
1.90
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2.0
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0
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1.96
115123369--115123536
35
4.6
35
84
7
194
33
24
10
31
1.90
115123364--115123536
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2.4
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33
23
10
31
1.90
115130862--115131033
75
2.4
73
83
8
217
33
23
11
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115130867--115131033
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10
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2.1
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0
0
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2.5
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1
1
28
1.08
115133851--115133962
45
2.5
45
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2
136
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2
2
24
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18
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0.99
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2
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0
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51
3
0
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2.3
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2.0
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2
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20
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1.9
18
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0
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1
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2.4
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1
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0
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19.4
9
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53
32
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2
61
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19
1.9
19
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56
66
0
2
30
1.06
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10
5.9
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76
23
53
55
0
1
42
1.10
115152828--115152872
20
2.3
20
85
7
58
57
4
2
35
1.31
115152839--115152893
9
5.7
10
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18
55
56
0
1
41
1.10
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2.1
26
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0
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60
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2
61
1.15
115153664--115153716
20
2.8
19
86
13
74
22
1
3
71
1.12
115153663--115153716
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2.9
19
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1
3
70
1.13
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2.0
39
97
0
147
44
5
14
35
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115170374--115170406
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1.9
17
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30
3
0
66
1.06
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24
2.4
24
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5
43
1.35
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2
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51
0
0
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1.00
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5
92
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0
0
18
0.70
115178670--115178700
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9
95
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80
0
0
19
0.71
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19.5
2
89
5
60
52
2
0
44
1.14
115186572--115186642
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2.3
31
86
11
94
45
1
4
49
1.30
115186574--115186653
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43
2
3
50
1.33
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19
2.8
19
83
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3
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1.17
115187648--115187720
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67
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2
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2.8
176
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18
30
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2.4
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0
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8
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2
22.0
2
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4
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48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.92
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11
54
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
41
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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4
47
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427