Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  33  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.24
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38
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9
132
33
23
12
31
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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20
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20
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19
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23
23
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8487901--8488040
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2.6
53
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219
17
23
23
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.95
8495007--8495147
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2.6
53
92
2
219
17
22
24
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1.95
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50
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8587878--8587911
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18
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50
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27
1.97
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85
2.5
85
79
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225
29
26
16
28
1.97
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12
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0
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0
34
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15
3.0
15
83
6
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32
0
20
1.51
8591728--8591770
22
2.0
22
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0
23
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18.0
7
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19
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21
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44
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0
22
1.53
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20
20
35
1.96
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22
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226
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5.7
40
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0
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34
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18
1.95
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15
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0
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1.78
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43
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22
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86
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5
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19
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8626098--8626783
173
4.0
172
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6
688
19
22
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1.95
8626300--8626824
43
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42
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19
21
22
36
1.95
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130
4.2
129
72
12
431
19
22
22
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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64
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15
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0
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1.93
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1.99
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1.99
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22
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7
20.6
7
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5
62
22
0
33
43
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8656667--8656802
42
3.2
42
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18
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1.8
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96
0
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29
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10
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3.8
46
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232
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0
317
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2.0
54
96
0
202
21
18
25
34
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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