Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  90  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23602228--23602255
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0
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14
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1.55
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0
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29
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0
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0
0
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9
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1
0
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1.03
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14
2.0
14
100
0
56
42
14
14
28
1.84
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19
2.1
18
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13
53
66
5
0
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70
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28
2.0
28
82
10
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10
5
42
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2.0
18
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17
1.88
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1.9
23
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4
61
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25
9
18
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2.2
24
100
0
104
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23
23
1.86
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47
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30
11
31
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1.92
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24
3.2
24
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23
61
28
13
32
25
1.93
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46
2.0
46
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1.87
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4.9
37
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2
303
23
19
30
26
1.98
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2.5
73
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1
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23
19
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1.98
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7.8
40
96
0
552
23
21
29
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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24
3.2
24
62
23
61
28
13
32
25
1.93
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23
3.2
23
62
23
57
29
10
32
28
1.90
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46
2.0
46
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0
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8
31
26
1.87
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292
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291
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12
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26
1.92
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4.9
37
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1.98
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2.6
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21
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1.95
23678004--23678239
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45
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144
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0
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2.0
20
90
4
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30
10
15
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2
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100
0
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0
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0
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1.00
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23
16
1.47
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17
2.5
17
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4
4
46
1.45
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2.0
26
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38
1.35
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1.9
30
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1
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1.28
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12
2.4
13
88
11
53
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23709160--23709221
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5.1
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94
0
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28
10
15
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1.79
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9
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9
100
0
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42
24
12
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1.86
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23
2.0
23
100
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30
4
17
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1.67
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18
3.2
18
79
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35
12
17
35
1.87
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11
5.0
11
80
10
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33
5
42
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1.73
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47
3.7
47
77
8
161
25
28
17
28
1.97
23760544--23760766
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2.4
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279
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3.7
40
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278
26
28
21
23
1.99
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79
1.9
79
98
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285
26
28
21
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1.99
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4.0
40
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280
27
29
20
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1.98
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12
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13
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17
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0
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0
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0
0
28
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43
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3
285
25
18
26
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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0
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0
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0
0
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0
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0
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21
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1.98
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38
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3
271
21
21
25
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23842396--23842435
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0
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
132
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0
505
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18
28
21
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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