Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  24  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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23
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188
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0
50
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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100
0
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0
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1.96
6477363--6477812
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24
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19
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15
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58
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38
1.15
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5
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1.40
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50
23
4
3
68
1.24
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20
3.1
19
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13
70
25
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1
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1.04
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10
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31
3
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1.15
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1
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18
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19
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3
1
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1.17
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19
2.0
19
90
10
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2
2
68
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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0
0
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0
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2.0
31
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2.1
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0
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1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6577780--6577840
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26
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3
26
39
1.72
6578837--6578882
23
2.0
22
84
12
58
34
2
19
43
1.63
6578982--6579070
45
2.0
45
97
0
169
26
17
6
48
1.72
6579490--6579549
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
6579520--6579566
22
2.2
20
85
7
58
70
4
0
25
1.05
6579536--6579577
20
2.0
21
86
9
59
71
7
0
21
1.09
6583900--6583933
6
6.0
6
86
13
54
85
14
0
0
0.60
6583900--6583931
16
1.9
17
93
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57
87
12
0
0
0.54
6585493--6585837
171
2.0
172
97
1
658
33
22
15
28
1.94
6586554--6586600
22
2.2
21
84
3
58
53
0
0
46
1.00
6587010--6587050
20
2.0
20
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57
46
4
0
48
1.23
6588349--6588613
3
87.3
3
65
15
55
26
8
4
60
1.45
6588423--6588499
24
3.1
24
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10
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27
6
2
63
1.32
6590174--6590207
17
2.0
17
100
0
68
29
0
17
52
1.45
6590482--6590530
20
2.5
20
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10
55
28
22
16
32
1.95
6591138--6591187
19
2.5
21
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59
68
2
0
30
1.01
6592278--6592326
20
2.3
20
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6
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44
2
0
53
1.12
6599774--6599815
21
2.0
22
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4
68
30
11
0
57
1.35
6600583--6600651
31
2.2
31
84
0
84
39
11
13
36
1.80
6602415--6602460
21
2.1
21
88
4
65
45
2
8
43
1.47
6602426--6602465
21
1.9
21
94
0
71
45
2
2
50
1.28
6605388--6605496
26
4.2
26
92
1
175
33
5
23
36
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6608824--6608968
3
48.7
3
76
11
120
59
2
5
32
1.35
6609313--6609345
2
16.5
2
93
0
57
48
0
3
48
1.17
6609371--6609444
3
25.0
3
93
2
123
63
1
0
35
1.03
6609551--6609606
25
2.3
24
84
3
67
41
5
16
37
1.71
6609711--6609762
3
17.7
3
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4
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61
3
1
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1.25
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28
3.1
28
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22
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59
1
9
29
1.36
6611344--6611376
14
2.4
14
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10
50
33
3
0
63
1.10
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30
3.0
29
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28
2
10
58
1.44
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30
2.0
30
100
0
122
54
13
0
32
1.39
6617305--6617342
15
2.5
15
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12
51
34
5
0
60
1.19
6617333--6617381
25
2.0
25
83
0
62
38
14
4
42
1.64
6617478--6617540
26
2.4
26
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5
74
36
7
6
49
1.58
6617818--6617872
20
2.5
22
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8
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34
5
5
54
1.46
6619921--6619969
6
8.3
6
75
20
50
34
0
0
65
0.93
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30
2.4
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0
106
40
4
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45
1.57
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27
2.0
28
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10
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25
0
14
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1.35
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56
2.1
58
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3
195
37
13
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1.82
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29
2.5
30
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38
1.77
6639488--6639514
2
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
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18
2.6
18
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60
44
0
4
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1.21
6639990--6640032
18
2.4
18
92
0
68
44
0
2
53
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6640459--6640511
24
2.3
23
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9
72
54
0
0
45
0.99
6641499--6641557
27
2.1
27
84
6
73
35
3
1
59
1.24
6642731--6642878
68
2.2
66
81
10
167
55
9
2
32
1.46
6643008--6643111
25
4.5
22
70
20
70
56
6
1
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1.37
6643018--6643060
19
2.2
20
87
4
61
60
6
2
30
1.35
6643069--6643151
27
3.1
24
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17
85
54
7
6
32
1.52
6643071--6643148
25
2.9
25
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15
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0
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0
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6643665--6643774
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4.2
26
94
0
166
34
5
22
37
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427