Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  79  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19760866--19760993
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63
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0
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19760895--19760994
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4
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20
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0
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0
0
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23
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2.0
29
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80
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20
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20
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19789148--19789201
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3.5
15
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2
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51
11
0
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22
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17
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0
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100
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0
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2.0
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27
90
0
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29
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39
1.84
19803906--19804089
81
2.3
81
91
0
296
29
22
8
39
1.84
19804068--19804266
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7.3
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12
156
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32
1.79
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2.1
81
82
0
212
31
21
7
38
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19804082--19804330
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1.8
136
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42
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9
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1.80
19804324--19804387
27
2.4
27
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2
85
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23
18
1.95
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25
1.9
25
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1.96
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25
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25
92
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31
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0
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50
0
0
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50
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209
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25
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2.0
49
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0
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14
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1.77
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2.5
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50
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0
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58
1.13
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2.0
29
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1.77
19838502--19838569
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18
82
0
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45
16
8
29
1.77
19838633--19838666
13
2.6
13
100
0
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14
0
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13
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30
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19842294--19842350
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2.3
25
85
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1
10
22
1.34
19849629--19849700
25
2.9
25
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74
27
23
27
20
1.99
19849681--19849750
25
2.8
25
72
8
70
35
20
25
18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19849655--19849750
50
1.9
50
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115
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21
27
18
1.97
19856584--19856617
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2
100
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0
0
50
1.00
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2.5
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271
26
28
24
21
1.99
19860271--19860331
18
3.8
18
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40
4
9
1.59
19860273--19860332
29
2.1
29
100
0
120
43
43
3
10
1.54
19862164--19862207
19
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40
0
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56
1.11
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207
20
20
16
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1.89
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18
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38
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1.75
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124
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24
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24
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2
58
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6
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22
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1
111
58
28
6
7
1.49
19887251--19887388
33
4.1
33
76
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57
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6
1.47
19887531--19887572
9
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9
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0
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33
1.78
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0
19
0
80
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0
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0
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2.1
12
100
0
50
24
16
24
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19956696--19956756
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27
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0
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20010481--20010517
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0
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24
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0
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50
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0
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35
83
8
105
29
20
6
43
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20057901--20057935
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0
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0
0
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20059062--20059147
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0
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0
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20089235--20089339
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3.3
32
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0
102
30
42
14
12
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427