Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  353  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102743632--102743741
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
102749425--102749532
26
4.2
25
91
4
171
34
5
23
37
1.78
102752788--102752976
96
2.0
95
88
1
279
32
16
7
43
1.76
102753758--102753796
21
1.9
20
89
5
60
33
0
20
46
1.51
102754347--102754529
48
3.7
48
85
4
215
21
14
27
36
1.92
102756531--102756563
11
3.0
11
90
0
57
0
21
0
78
0.75
102771502--102771604
50
2.1
49
85
1
134
39
3
4
51
1.42
102774155--102774211
2
29.5
2
80
19
68
49
0
3
47
1.18
102776455--102776492
17
2.2
17
86
9
51
50
2
7
39
1.46
102778067--102778096
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
102788008--102788033
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
102788122--102788170
22
2.1
24
85
7
66
55
4
6
34
1.44
102789051--102789086
18
2.1
17
89
5
54
19
5
0
75
1.00
102790755--102790788
18
1.9
18
88
5
52
32
20
0
47
1.51
102791642--102791768
66
1.9
66
93
3
220
29
23
19
27
1.98
102794474--102794520
25
2.0
23
83
8
58
34
6
4
55
1.45
102795711--102795832
38
3.2
37
73
15
115
28
23
18
29
1.97
102795727--102795850
37
3.3
38
71
15
103
32
20
17
29
1.96
102800294--102800319
11
2.4
11
100
0
52
0
84
0
15
0.62
102801552--102801590
17
2.2
18
90
4
62
58
0
5
35
1.20
102801548--102801600
17
3.3
15
82
7
52
52
0
5
41
1.25
102809352--102809423
32
2.2
32
80
11
83
73
18
5
2
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102809348--102809440
46
2.0
46
89
10
145
69
20
6
3
1.24
102809367--102809459
46
2.0
45
87
2
132
76
11
7
4
1.14
102809401--102809460
30
2.0
31
86
3
86
80
8
6
5
1.03
102810114--102810155
2
21.0
2
90
0
66
47
2
2
47
1.28
102810187--102810216
15
2.0
15
100
0
60
26
0
6
66
1.16
102810233--102810332
37
2.6
37
74
21
91
32
5
5
58
1.41
102811978--102812013
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
102817130--102817304
71
2.5
69
87
3
235
28
14
22
34
1.93
102817304--102817468
71
2.3
71
84
7
219
23
14
19
43
1.87
102817401--102817875
140
3.4
140
97
0
887
25
16
21
36
1.94
102817809--102817953
76
1.9
76
84
4
193
25
20
24
29
1.99
102817944--102817978
14
2.5
14
95
0
61
17
17
5
60
1.55
102818112--102818138
14
1.9
14
100
0
54
14
14
7
62
1.51
102818113--102818146
14
2.4
14
90
0
50
17
20
5
55
1.62
102818279--102818305
14
1.9
14
100
0
54
14
14
7
62
1.51
102817813--102818639
167
4.9
167
90
3
1189
28
19
20
31
1.97
102818280--102818313
14
2.4
14
90
0
50
17
20
5
55
1.62
102818312--102818455
75
1.9
76
84
2
191
31
20
21
25
1.98
102817813--102818639
335
2.5
336
90
3
1222
28
19
20
31
1.97
102818459--102818797
88
4.2
77
75
13
272
28
18
18
34
1.95
102818293--102818797
251
2.1
240
84
5
636
28
19
18
32
1.96
102818696--102818731
14
2.7
13
83
8
54
33
13
5
47
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102819459--102819547
48
1.9
48
88
6
139
74
14
7
3
1.18
102819456--102819557
48
2.2
45
82
5
132
75
14
6
2
1.13
102819507--102819567
30
2.0
32
84
12
83
78
8
8
4
1.08
102819474--102819565
46
2.0
46
85
6
123
76
11
7
4
1.15
102820022--102820096
39
1.9
39
83
5
98
33
6
5
54
1.49
102820271--102820295
13
1.9
13
100
0
50
28
0
0
72
0.86
102823885--102823933
21
2.3
22
86
10
66
4
38
0
57
1.18
102825390--102825426
19
2.0
19
89
5
58
24
21
2
51
1.61
102833812--102833871
26
2.4
24
83
8
75
68
3
0
28
1.05
102833842--102833900
21
2.8
22
85
7
70
69
6
0
23
1.12
102841405--102841594
54
3.6
53
80
12
210
34
15
24
25
1.95
102849101--102849202
52
1.9
52
84
5
134
32
17
27
22
1.96
102856726--102856779
15
3.3
15
74
18
54
44
0
1
53
1.11
102856821--102856918
17
5.6
16
70
17
54
46
0
0
53
1.00
102856872--102856915
22
2.0
22
90
0
70
40
0
0
59
0.98
102858532--102858646
60
1.9
60
92
0
194
34
0
12
52
1.45
102858781--102858916
60
2.3
59
82
11
161
26
0
17
55
1.47
102859940--102859983
7
6.4
7
97
2
81
29
0
0
70
0.88
102859947--102859985
4
10.8
4
79
20
50
28
0
0
71
0.86
102865677--102865800
60
2.1
60
96
0
230
37
8
17
37
1.80
102866154--102866195
21
2.0
21
85
0
57
35
9
7
47
1.64
102869824--102869882
29
2.1
28
81
12
68
50
1
15
32
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102870252--102870449
105
1.9
101
84
6
263
34
14
23
27
1.93
102870389--102870467
33
2.4
33
79
12
90
32
16
24
26
1.96
102872218--102872273
24
2.3
24
82
8
69
37
19
26
16
1.92
102883742--102883929
45
4.2
45
89
1
234
24
8
50
17
1.73
102883881--102883998
36
3.3
36
93
0
200
27
5
47
19
1.72
102886511--102886553
10
4.3
10
85
8
61
76
0
11
11
1.02
102886853--102886897
24
1.9
24
95
4
83
57
0
13
28
1.36
102888369--102888669
54
5.5
53
73
8
230
32
14
19
33
1.92
102888374--102888669
109
2.7
109
79
7
269
33
14
19
32
1.92
102890452--102890495
3
15.0
3
86
13
65
31
2
0
65
1.05
102892639--102892692
20
2.7
20
97
0
99
20
38
31
9
1.84
102894564--102894615
27
1.9
27
88
0
77
61
1
15
21
1.43
102894490--102894689
76
2.7
76
81
6
196
59
2
15
23
1.47
102894687--102894791
49
2.2
47
79
6
122
63
1
9
24
1.34
102894746--102894834
20
4.2
20
71
13
72
66
0
8
24
1.20
102894827--102894893
5
12.8
5
76
9
62
61
0
17
20
1.35
102894821--102894887
16
4.2
16
77
12
66
59
0
16
23
1.37
102894827--102894887
21
2.9
21
87
4
88
60
0
18
21
1.36
102894827--102894886
11
5.6
11
71
13
54
60
0
18
21
1.37
102895082--102895156
37
2.1
35
80
7
89
68
2
4
25
1.21
102895195--102895287
24
3.6
24
80
20
107
66
0
8
24
1.19
102895209--102895300
14
6.6
14
70
25
63
67
0
8
23
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102895195--102895308
24
4.9
24
71
20
82
67
0
7
24
1.17
102897304--102897443
55
2.6
55
91
1
228
29
24
17
28
1.97
102897412--102897577
56
2.9
56
81
7
203
35
17
16
30
1.92
102904126--102904166
12
3.8
11
78
15
50
43
2
0
53
1.13
102904122--102904192
19
3.7
18
83
16
90
50
2
0
46
1.16
102904122--102904196
20
4.1
18
86
10
82
50
2
0
46
1.15
102904200--102904226
10
2.7
10
100
0
54
74
0
0
25
0.83
102904201--102904247
23
2.1
22
84
11
60
72
0
4
23
1.02
102904290--102904320
16
1.9
16
93
0
53
35
6
9
48
1.62
102904738--102904791
11
4.9
11
76
0
54
72
1
1
24
1.05
102928653--102928829
47
3.8
46
80
13
218
20
20
29
29
1.98
102932612--102932699
31
2.8
31
77
6
97
28
10
11
50
1.71
102940004--102940050
21
2.3
19
82
13
58
27
2
2
68
1.13
102942746--102942972
49
4.6
49
86
2
283
30
26
16
25
1.97
102942746--102942979
99
2.3
100
84
3
312
29
27
17
25
1.97
102945304--102945340
17
2.2
17
95
0
65
29
51
0
18
1.47
102945705--102945839
3
45.0
3
71
12
82
28
3
3
63
1.28
102945710--102945828
17
6.8
18
68
18
90
29
4
2
63
1.26
102945712--102945839
29
4.6
29
72
16
81
29
3
3
63
1.28
102945986--102946027
3
14.3
3
82
5
50
30
0
0
69
0.89
102952469--102952837
126
2.8
131
84
10
495
28
19
21
31
1.97
102952635--102952893
133
1.9
135
81
7
314
29
20
21
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102953156--102953383
43
5.4
43
65
17
129
37
22
22
17
1.94
102952762--102953304
265
2.1
260
82
6
639
33
19
21
25
1.96
102953171--102953616
84
5.3
84
85
3
553
36
23
20
19
1.95
102953162--102953583
167
2.5
168
87
4
571
37
22
21
18
1.94
102953924--102953962
17
2.3
17
95
0
69
28
51
0
20
1.48
102954319--102954466
3
49.3
3
77
9
133
29
3
2
64
1.24
102956504--102956555
19
2.5
20
81
9
61
53
5
0
40
1.25
102965483--102965583
27
3.7
27
77
2
94
25
13
25
34
1.93
102968616--102968657
16
2.6
17
81
11
52
4
30
0
64
1.14
102980774--102981144
126
2.8
132
86
8
540
29
19
20
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427