Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10812076--10812473
134
3.0
134
76
2
352
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22
18
31
1.97
10812062--10812495
45
9.7
45
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7
229
27
23
18
31
1.97
10812476--10812672
89
2.2
88
82
4
252
24
22
22
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1.99
10812622--10813364
132
5.6
132
83
2
803
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25
18
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1.98
10812778--10812962
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4.2
44
70
9
135
23
26
19
30
1.98
10813308--10813552
44
5.6
44
68
11
151
28
25
18
28
1.98
10812639--10813372
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2.8
263
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900
25
25
19
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1.98
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2.1
176
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1
519
26
26
17
28
1.98
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2.0
308
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1
838
26
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18
29
1.98
10813349--10813644
132
2.2
132
88
0
430
27
25
18
28
1.98
10814414--10814472
30
2.0
30
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0
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32
15
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1.76
10820651--10820923
89
3.1
88
67
17
240
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23
17
32
1.97
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176
3.5
176
88
1
825
26
24
17
30
1.97
10820566--10820834
87
3.1
87
65
18
203
28
23
17
30
1.97
10820864--10820965
43
2.3
44
79
12
111
27
23
18
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1.98
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20
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1.98
10834529--10834567
19
2.1
19
85
9
53
20
46
12
20
1.83
10834570--10834614
10
4.4
10
77
5
54
22
24
22
31
1.99
10834558--10834606
20
2.4
20
86
3
62
20
26
22
30
1.98
10834636--10834668
12
2.8
12
86
4
50
36
3
9
51
1.49
10836792--10836839
23
2.1
23
84
7
62
56
2
4
37
1.30
10840132--10840170
15
2.6
14
84
8
51
56
0
15
28
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10840175--10840215
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2.1
19
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4
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70
0
4
24
1.06
10840313--10840470
3
53.3
3
76
9
83
58
3
8
29
1.44
10840449--10840476
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0
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0
0
32
0.91
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35
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11
84
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8
16
25
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2
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2
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0
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0
3
48
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2.3
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100
0
50
16
0
0
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24
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79
28
16
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55
1.41
10865469--10865507
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2.1
19
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0
51
56
5
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35
1.35
10867044--10867082
19
2.1
19
95
0
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33
5
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10868905--10868970
33
2.0
33
100
0
132
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3
21
45
1.67
10871800--10871883
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3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
10874454--10874595
24
6.0
24
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209
28
21
21
28
1.99
10874475--10874594
23
5.1
23
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195
30
20
20
28
1.98
10874475--10874596
47
2.6
47
96
0
217
29
20
21
28
1.98
10874653--10874709
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
10874641--10874711
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
10874646--10874700
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
10874748--10874795
25
1.9
25
86
0
69
27
14
25
33
1.94
10876010--10876393
27
13.8
27
81
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356
40
8
22
28
1.83
10876099--10876180
38
2.2
38
82
4
94
40
7
29
23
1.81
10876082--10876208
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2.0
65
87
0
182
40
7
25
25
1.82
10876011--10876291
146
1.9
146
91
0
454
41
8
21
28
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10876390--10876488
27
3.7
26
79
5
99
30
8
19
42
1.80
10876382--10876488
54
2.0
54
81
3
126
30
8
20
40
1.82
10876399--10876503
27
3.9
27
78
9
81
34
7
17
40
1.78
10877507--10877646
27
5.2
27
87
2
174
17
23
22
35
1.95
10879061--10879115
28
2.0
28
85
7
76
50
5
9
34
1.57
10879522--10879689
83
2.0
83
96
3
313
60
7
5
26
1.46
10880995--10881035
15
2.7
15
88
0
55
9
0
7
82
0.83
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2.2
18
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63
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0
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1.09
10891369--10891415
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1.9
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44
6
0
48
1.28
10891551--10891604
16
3.4
16
87
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74
29
27
7
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1.84
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2.1
14
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0
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23
10
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1.52
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2.1
136
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0
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18
24
1.97
10897727--10897779
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2.0
26
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26
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1.92
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26
3.2
26
96
0
150
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25
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33
1.77
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29
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1.93
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144
29
23
13
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1.93
10911889--10911920
11
2.8
12
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12
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21
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0
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19
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0
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3
16
1.48
10929722--10929767
21
2.2
21
84
0
56
2
50
19
28
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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34
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10938096--10938227
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24
3
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1.71
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0
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0
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1.70
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0
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9
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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118
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132
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175
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0
1
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0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10998864--10998927
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0
0
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0
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0
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2.1
21
87
4
63
33
2
2
62
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427