Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  101  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26787428--26787499
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0
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0
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7
9.9
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3
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14
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34
0
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2.1
21
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0
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1.64
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132
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131
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471
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19
19
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43
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179
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0
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16
19
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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24
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106
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13
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65
1
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30
1.17
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18
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13
76
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3
29
1.17
26823229--26823315
27
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176
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132
95
0
582
26
22
19
31
1.98
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26
22
18
31
1.97
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2.9
68
87
2
276
27
21
23
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26825087--26826063
43
22.4
45
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623
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22
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1.96
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131
6.5
131
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1181
20
21
22
36
1.95
26826127--26826253
66
1.9
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227
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1.88
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1.17
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70
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1.93
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17
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2.2
22
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0
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26
26
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
1.96
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19
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2
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44
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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