Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  331  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96502593--96502636
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21
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138
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2.8
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26
1.27
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0
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96540289--96540321
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2.3
15
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5
50
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3
0.71
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100
0
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0
0
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13
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24
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2.0
51
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1.99
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2.3
93
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225
22
29
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25
1.99
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13
100
0
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20
38
23
17
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96592625--96592680
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1.12
96592625--96592680
16
3.7
15
81
6
60
19
5
1
73
1.12
96594383--96594434
12
4.2
12
78
7
50
23
3
1
71
1.13
96594391--96594433
20
2.3
19
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0
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50
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16
16
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21
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1.15
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19
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24
4
1
68
1.18
96613616--96613767
40
3.8
39
77
6
119
28
22
25
23
1.99
96613654--96613783
40
3.2
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22
26
25
2.00
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2.0
27
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20
2.3
20
100
0
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0
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0
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0
0
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16
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3.5
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3
117
28
22
26
23
1.99
96629810--96629938
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3.2
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22
27
25
2.00
96637767--96637933
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4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96641114--96641226
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31
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462
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32
9
28
1.89
96641337--96641602
97
2.7
98
95
1
480
29
32
9
28
1.89
96641337--96641602
146
1.8
147
94
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471
29
32
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28
1.89
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4.4
29
96
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222
26
31
15
26
1.96
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84
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16
25
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2.1
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100
0
156
20
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1.97
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15
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1.96
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2.8
58
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215
25
31
17
26
1.97
96651160--96651323
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1.9
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87
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242
25
31
17
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1.97
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3.1
37
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21
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19
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1.89
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1.57
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0
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40
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
69
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11
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25
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22
36
1.94
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15
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1.96
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16
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1.96
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158
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2
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1.96
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0
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1.96
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1.95
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1.80
96706440--96706537
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1.80
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2
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0
0
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1.00
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19
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1.9
25
83
8
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20
2
6
70
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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0
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50
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15
23
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96789317--96789406
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3.0
30
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0
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162
42
4
2
50
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427