Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  395  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114462959--114463016
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27
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6
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0
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0
0
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1.00
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0
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1.9
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4.6
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167
33
23
10
32
1.88
114473586--114473752
35
4.6
35
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7
201
33
24
10
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1.90
114473581--114473752
75
2.4
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23
11
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1.90
114475897--114475973
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3.4
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0
0
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0
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41
0
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28
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0
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0
0
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0
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3.4
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112
23
20
28
28
1.99
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2.2
19
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46
0
24
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2.8
53
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29
27
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75
3.0
73
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2.8
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10
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37
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114500806--114500845
11
3.7
11
83
6
55
82
5
0
12
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114501547--114501608
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2.6
24
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29
3
4
62
1.31
114501592--114501644
23
2.2
23
83
6
61
37
9
5
47
1.60
114501934--114502016
25
3.2
25
77
11
71
32
6
6
55
1.49
114502121--114502161
11
3.9
11
81
12
50
39
0
4
56
1.21
114502123--114502171
20
2.3
21
82
6
64
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2
6
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1.37
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46
4.4
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122
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3
5
55
1.41
114502149--114502214
26
2.5
27
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2.2
30
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48
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3
39
1.50
114507717--114507796
28
2.9
27
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1
3
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2.1
16
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0
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19
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52
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1.20
114518704--114518740
19
2.0
18
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5
65
54
5
0
40
1.24
114521626--114521654
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2.0
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0
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0
0
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22
2.4
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68
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0
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1.06
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14
2.2
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6
46
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36
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2.0
21
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0
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2
1
40
1.21
114535176--114535253
33
2.4
32
79
14
79
53
2
1
42
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114535507--114535553
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1.9
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4
46
1.21
114535510--114535561
19
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19
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52
46
0
1
51
1.12
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20
2.0
22
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45
0
0
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13
2.9
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50
54
0
0
45
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114536554--114536590
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2.3
16
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58
59
0
0
40
0.97
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15
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51
49
1
1
47
1.22
114544704--114544748
22
2.0
24
91
8
76
51
17
20
11
1.75
114544725--114544775
22
2.4
21
80
3
57
49
15
19
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0
0
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42
1.84
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2.1
21
100
0
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42
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2.0
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2.3
96
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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20
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
8
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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