Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  298  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86372614--86372661
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0
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2.0
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0
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29
2.8
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155
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2
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3
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1.06
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1
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55
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10
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2.7
29
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4
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32
18
26
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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56
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0
1.00
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0
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1.56
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1.97
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19
2.2
19
86
4
57
70
4
2
21
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86496314--86496387
31
2.4
31
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0
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0
0
62
0.95
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15
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0
0
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52
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17
1.45
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50
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1.59
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2
411
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26
20
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1.97
86503043--86503284
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2.0
124
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407
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27
20
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1.97
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405
19
26
20
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1.97
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2.2
12
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51
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29
1.95
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.99
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0
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26
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44
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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12
41
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86630039--86630083
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2
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0
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0
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1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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