Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  293  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84685278--84685616
123
2.8
123
95
0
588
33
25
10
30
1.90
84688233--84688306
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
84688290--84688364
28
2.6
28
78
2
87
22
20
36
21
1.96
84688233--84688364
58
2.3
57
80
3
131
25
17
33
24
1.96
84696109--84696182
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
84696166--84696240
28
2.6
28
78
2
87
22
20
36
21
1.96
84696109--84696240
58
2.3
57
80
3
131
25
17
33
24
1.96
84703423--84703666
40
6.1
40
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2
294
27
26
20
25
1.99
84703753--84703941
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64
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142
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11
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1.91
84703635--84703973
123
2.8
123
95
0
597
33
25
10
30
1.90
84709749--84709792
21
2.1
21
82
0
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34
25
2
38
1.68
84710950--84710981
7
4.6
7
100
0
64
28
0
12
59
1.34
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21
2.4
21
96
0
93
35
43
15
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1.71
84714600--84714652
22
2.3
24
87
6
74
32
18
28
20
1.97
84714618--84714660
22
2.0
22
86
9
61
27
20
30
20
1.98
84743878--84743916
20
2.0
20
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10
2
15
1.23
84745608--84745830
48
4.7
46
78
14
197
27
21
29
21
1.99
84745597--84745830
96
2.4
94
84
6
292
27
21
29
21
1.99
84751764--84751980
98
2.3
95
80
9
239
39
20
8
31
1.83
84752106--84752176
20
3.8
18
73
17
56
71
1
4
22
1.11
84752107--84752176
9
7.4
9
72
15
61
71
1
4
22
1.12
84752433--84752535
10
10.1
11
71
19
62
38
0
0
60
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84752432--84752487
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20
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7
71
42
1
0
55
1.10
84752432--84752536
20
5.2
21
79
10
78
38
0
0
60
1.03
84752446--84752536
20
4.4
21
79
6
89
36
1
0
62
1.02
84752432--84752536
11
10.4
9
76
13
66
38
0
0
60
1.03
84752787--84752811
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
84754152--84754255
32
3.2
32
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17
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38
1
3
55
1.29
84754107--84754304
67
3.0
67
97
0
380
35
2
3
59
1.25
84754853--84754891
8
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23
2
0
74
0.94
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19
2.7
19
87
0
75
56
5
0
37
1.23
84756693--84756735
21
2.0
21
100
0
86
44
13
9
32
1.76
84759961--84760049
37
2.4
38
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1
126
34
8
21
34
1.85
84762684--84762725
3
14.0
3
89
0
57
4
2
61
30
1.29
84768515--84768558
19
2.3
19
80
0
52
15
22
29
31
1.95
84776386--84776420
18
1.9
18
88
0
52
17
11
2
68
1.31
84776411--84776466
20
2.7
19
81
10
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16
5
3
75
1.13
84789926--84790010
35
2.4
35
84
5
91
38
9
22
29
1.85
84789944--84790014
35
2.0
35
97
0
133
36
11
18
33
1.86
84790698--84790726
12
2.5
12
94
5
51
86
0
13
0
0.58
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15
2.2
15
89
5
50
82
0
14
2
0.79
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25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
84798515--84798573
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
84798624--84798718
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84798625--84798718
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
84798910--84799072
38
4.4
38
84
11
232
38
17
22
22
1.93
84798934--84799049
31
3.5
31
80
15
142
41
14
20
23
1.89
84798910--84799049
69
2.0
69
98
0
271
39
15
21
23
1.92
84808829--84808868
17
2.4
17
100
0
80
22
7
12
57
1.60
84818224--84818269
21
2.2
21
100
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92
34
30
15
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1.93
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14
2.1
15
93
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53
63
13
10
13
1.52
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426
2.0
426
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1467
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20
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1.98
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19
2.0
19
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28
21
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1.64
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25
3.1
23
67
14
55
35
31
14
19
1.92
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25
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25
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6
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34
33
14
17
1.90
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50
3.2
50
87
1
225
36
28
12
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1.91
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28
2.0
28
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0
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20
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1.92
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16
1.9
16
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0
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0
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0
0
24
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0
0
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0
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30
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0
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18
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18
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0
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57
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1.47
84880097--84880129
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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4.2
26
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2
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23
8
32
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.97
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24
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
19
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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