Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  269  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77433720--77433810
27
3.4
27
92
0
146
25
20
19
34
1.97
77440064--77440205
29
4.9
29
85
1
97
23
30
15
29
1.95
77440063--77440221
57
2.8
58
83
1
185
23
32
15
28
1.95
77440101--77440222
29
4.2
29
89
2
165
24
28
15
31
1.96
77443519--77443569
27
1.9
26
84
4
66
35
17
27
19
1.94
77444221--77444337
27
4.3
27
91
0
171
28
22
16
33
1.95
77444208--77444320
54
2.1
54
80
3
120
30
21
20
28
1.98
77448635--77448710
37
2.1
37
83
14
95
25
7
23
43
1.80
77450889--77450917
5
5.8
5
100
0
58
41
0
17
41
1.49
77452171--77452293
42
2.9
43
77
7
126
31
15
21
31
1.94
77453902--77454002
33
3.1
33
80
5
89
28
24
11
34
1.91
77453940--77454047
33
3.3
33
79
3
103
32
24
12
31
1.91
77455574--77455732
42
3.7
43
75
12
130
28
25
16
28
1.97
77461131--77461315
79
2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
77461124--77461315
40
4.8
39
76
8
163
23
28
23
24
2.00
77469129--77469313
79
2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
77469122--77469313
40
4.8
39
76
8
163
23
28
23
24
2.00
77479456--77479622
40
4.2
41
80
5
164
24
26
22
26
2.00
77480448--77480493
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
77484868--77485026
29
5.5
29
81
5
171
26
16
30
25
1.97
77484864--77484997
57
2.3
58
82
6
166
26
15
31
26
1.96
77491868--77491934
34
1.9
35
90
3
109
32
16
22
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77497356--77497426
29
2.5
28
88
4
99
30
15
26
26
1.96
77497327--77497426
27
3.5
29
82
6
114
30
15
27
28
1.96
77499055--77499118
32
2.0
32
100
0
128
28
12
15
43
1.83
77500620--77500717
41
2.4
41
89
1
144
30
22
12
34
1.91
77505718--77505805
43
2.0
43
86
0
122
21
21
2
54
1.56
77511150--77511204
18
3.1
18
89
7
78
23
1
10
63
1.36
77517822--77517852
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
77534327--77534434
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
77542018--77542178
70
2.3
70
95
2
288
19
29
16
34
1.94
77545686--77545814
40
3.3
39
84
4
170
23
28
25
22
1.99
77553737--77553866
40
3.3
39
83
4
163
23
28
25
23
1.99
77560622--77560771
65
2.3
65
83
0
174
35
23
18
23
1.96
77570879--77570921
22
2.0
22
100
0
86
18
13
30
37
1.90
77574224--77574404
46
3.9
46
80
8
172
22
32
18
26
1.97
77578986--77579033
22
2.1
22
81
11
53
47
6
2
43
1.40
77581999--77582116
36
3.3
36
85
4
141
15
13
30
40
1.86
77585381--77585511
30
4.5
30
86
8
180
29
25
12
32
1.93
77585380--77585511
58
2.3
58
86
4
185
28
26
12
31
1.93
77588843--77588898
21
2.7
21
91
0
94
17
33
32
16
1.92
77592124--77592302
40
4.5
40
85
3
220
26
27
21
24
1.99
77605371--77605399
15
1.9
15
100
0
58
34
24
13
27
1.93
77609527--77609801
39
7.1
39
89
0
417
24
23
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77609527--77609806
117
2.4
117
94
0
481
25
22
28
23
1.99
77612650--77612819
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
77620754--77620920
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
77620754--77620920
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
77621745--77621790
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
77625780--77625867
45
2.0
45
88
0
131
37
23
12
26
1.90
77627425--77627485
30
2.0
30
93
6
106
49
11
19
19
1.78
77631093--77631129
18
2.0
20
89
10
60
29
32
18
18
1.96
77636542--77636567
1
26.0
1
100
0
52
0
0
0
100
0.00
77638385--77638410
1
26.0
1
100
0
52
0
0
0
100
0.00
77642380--77642428
23
2.2
23
85
3
64
22
10
6
61
1.50
77660078--77660183
53
2.0
53
96
0
194
30
17
17
33
1.94
77664326--77664876
44
12.0
44
70
12
250
32
19
20
28
1.97
77664323--77664675
190
1.9
190
80
9
416
31
20
19
28
1.97
77664824--77664920
51
1.9
51
89
0
149
31
17
22
27
1.97
77664663--77664930
133
2.0
134
85
8
362
32
16
21
29
1.95
77664664--77664946
139
2.1
134
84
8
358
32
16
21
30
1.95
77672831--77672961
65
2.0
65
100
0
262
32
29
9
29
1.88
77676007--77676101
29
3.3
28
78
7
93
26
31
14
27
1.95
77676064--77676124
29
2.1
29
81
3
70
29
27
13
29
1.94
77678317--77678391
37
2.0
37
100
0
150
62
5
10
21
1.47
77678393--77678448
3
18.7
3
100
0
112
33
0
32
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77679125--77679185
21
3.0
20
75
11
61
40
11
0
47
1.40
77679125--77679189
20
3.2
20
77
12
69
38
12
0
49
1.41
77679397--77679447
23
2.4
22
75
18
54
47
7
0
45
1.32
77679612--77679648
6
6.5
6
81
12
51
89
0
10
0
0.49
77679611--77679644
12
2.8
12
95
4
59
91
0
8
0
0.43
77679610--77679644
18
2.0
17
94
5
61
91
0
8
0
0.42
77679610--77679648
9
4.1
10
83
9
55
89
0
10
0
0.48
77679763--77679812
25
2.0
25
88
7
75
64
0
2
34
1.05
77682932--77683518
196
3.0
196
98
0
1138
34
11
18
35
1.88
77683682--77683898
40
5.4
40
90
0
335
18
20
29
31
1.96
77685517--77685549
14
2.3
15
94
5
59
72
6
0
21
1.05
77686742--77686773
15
2.1
15
100
0
64
28
12
6
53
1.62
77688503--77688581
29
2.7
29
90
0
113
40
10
29
20
1.85
77688503--77688593
29
3.1
29
87
0
101
38
12
27
21
1.89
77692892--77692924
2
16.5
2
93
0
57
48
3
0
48
1.17
77693007--77693050
2
22.0
2
95
0
79
47
0
0
52
1.00
77693651--77693699
2
24.5
2
100
0
98
48
0
0
51
1.00
77694213--77694456
131
1.9
130
90
2
391
28
20
18
32
1.96
77702037--77702091
23
2.5
23
82
11
62
25
5
23
45
1.74
77704624--77706052
206
7.0
206
84
2
1754
30
17
20
31
1.96
77712061--77712170
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
77713598--77713672
26
2.8
26
84
8
80
34
22
10
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77713776--77713902
27
4.7
27
87
1
173
18
24
22
33
1.97
77717619--77717739
48
2.6
48
85
2
156
35
14
22
27
1.93
77722641--77722695
13
4.2
13
88
6
85
72
0
10
16
1.11
77722641--77722685
4
10.8
4
81
9
54
73
0
8
17
1.08
77722641--77722701
25
2.4
26
86
5
90
73
0
11
14
1.09
77726728--77726752
13
1.9
13
100
0
50
72
0
12
16
1.13
77743898--77743937
19
2.1
19
100
0
80
40
25
5
30
1.77
77746729--77746789
26
2.4
25
81
10
70
68
3
0
27
1.05
77746760--77746818
21
2.8
22
85
7
70
69
6
0
23
1.12
77752469--77752514
21
2.3
19
88
11
65
34
0
2
63
1.07
77753822--77753855
18
1.9
18
88
5
52
47
0
2
50
1.16
77767592--77767646
27
2.0
27
89
0
83
40
5
14
40
1.69
77767925--77767949
12
2.1
12
100
0
50
40
16
16
28
1.89
77772382--77772547
47
3.6
44
82
10
192
21
31
19
27
1.98
77777888--77777941
18
3.1
18
72
5
56
70
1
11
16
1.25
77784790--77785104
46
6.7
46
75
11
196
29
19
26
24
1.99
77784781--77785153
92
4.0
91
76
11
281
28
19
26
25
1.98
77784790--77785146
46
7.6
48
71
17
164
28
19
26
24
1.98
77784838--77785146
142
2.2
139
82
8
358
28
18
26
25
1.98
77784929--77785153
98
2.4
91
83
6
263
27
19
26
26
1.99
77789453--77789695
50
4.9
50
88
1
346
22
28
19
29
1.98
77797098--77797301
106
1.9
106
95
0
372
34
20
6
39
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77799571--77799615
24
1.9
24
86
4
65
37
20
22
20
1.94
77802093--77802258
46
3.6
44
82
10
185
23
30
19
26
1.98
77802131--77802304
94
1.9
92
82
9
219
24
29
18
27
1.98
77804073--77804248
89
2.0
88
92
3
291
44
5
18
31
1.72
77811080--77811135
29
2.0
28
85
3
76
64
5
5
25
1.36
77819334--77819428
47
2.0
47
95
0
172
28
16
25
29
1.97
77824795--77824871
36
2.2
36
90
2
120
15
11
15
57
1.66
77831412--77831450
19
2.1
19
85
0
51
61
10
0
28
1.28
77832085--77832168
36
2.3
36
97
0
159
30
17
41
9
1.82
77839172--77839222
26
2.0
25
85
11
68
25
5
15
52
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427