Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  352  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102477078--102477191
9
12.6
9
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17
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69
3
0
26
1.10
102477091--102477145
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5
0
30
1.17
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8
83
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1
1
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8
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0
0
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102477561--102477615
19
2.8
21
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13
64
34
0
0
65
0.93
102477607--102477644
16
2.4
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0
67
15
0
0
84
0.63
102477741--102477934
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2.1
91
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243
32
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37
1.84
102481579--102481626
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2.2
22
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55
56
0
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23
23
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18
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0
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35
10
16
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102483239--102483318
36
2.2
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0
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35
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28
2.0
28
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1
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1.56
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50
3.9
49
81
5
189
28
25
18
27
1.98
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1.8
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242
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25
18
26
1.98
102485138--102485327
101
1.9
99
82
6
240
28
25
18
26
1.98
102488849--102488897
6
8.2
6
95
0
80
12
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16
16
1.70
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50
0
25
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1.9
24
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24
0
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71
1.05
102494448--102494492
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1.9
23
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13
65
24
0
4
71
1.05
102495472--102495528
28
2.0
30
89
6
91
52
19
1
26
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102498042--102498124
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5.7
14
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2
49
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102500933--102500984
25
2.1
25
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0
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17
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7
40
1.78
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2.0
40
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5
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40
7
12
39
1.72
102517295--102517351
19
3.0
21
75
17
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1
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3.9
13
73
0
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5
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35
1.78
102524771--102524803
9
3.7
9
95
0
57
39
12
18
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1.87
102524771--102524816
9
5.0
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2
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15
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5
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0
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19
19
19
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2
42
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2.2
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73
7
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3
3
40
1.34
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21
2.0
21
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17
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3.4
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15
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7
55
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102548836--102548900
18
3.6
18
74
17
62
36
3
6
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1.41
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2
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0
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0
0
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130
3.1
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436
33
17
17
31
1.93
102553648--102554061
134
3.1
130
82
4
472
33
17
17
31
1.93
102555113--102555149
2
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2
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0
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0
0
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0
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33
5
23
37
1.78
102570286--102570333
21
2.3
21
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12
2
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2.1
136
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0
552
24
18
25
31
1.98
102571846--102571888
12
3.6
12
100
0
86
9
25
51
13
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102576761--102576870
26
4.2
26
92
0
175
33
5
23
37
1.78
102578651--102578935
136
2.1
136
98
0
552
24
18
25
31
1.98
102581818--102581862
2
22.5
2
95
0
81
48
0
2
48
1.13
102582541--102582586
21
2.2
21
88
0
65
8
39
23
28
1.84
102582553--102582593
21
2.0
21
85
0
55
14
39
21
24
1.91
102582687--102582729
20
2.2
20
87
4
61
13
23
32
30
1.93
102586205--102586237
14
2.3
15
85
15
52
39
12
21
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1.88
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2.9
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100
0
304
52
12
7
26
1.66
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10
3.7
10
85
7
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61
0
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1.11
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2.7
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35
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10
29
1.89
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2.3
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0
0
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0.98
102601939--102601990
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2
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18
60
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0
0
57
0.98
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32
5
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23
4
0
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23
5
0
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9
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1.54
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0
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24
10
7
58
1.55
102602945--102602979
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
102603897--102604088
84
2.3
85
82
5
228
40
17
17
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102603897--102604105
43
4.9
43
74
4
181
40
18
16
24
1.91
102613063--102613265
101
2.0
101
92
0
334
27
29
12
31
1.93
102619259--102619292
13
2.6
13
90
0
50
17
0
2
79
0.86
102623082--102623152
8
8.9
8
98
0
133
38
1
0
60
1.06
102623211--102623258
23
2.1
23
84
0
60
43
6
10
39
1.64
102623342--102623404
27
2.3
27
78
10
67
65
4
28
1
1.22
102624280--102624357
40
2.0
39
87
7
115
37
10
17
34
1.84
102626565--102626696
50
2.6
51
82
3
167
37
12
13
35
1.83
102636782--102636830
20
2.4
21
83
6
66
65
0
0
34
0.93
102639489--102639521
2
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2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
102660510--102660578
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5
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36
1.45
102661783--102661905
3
41.0
3
70
9
81
26
5
2
65
1.28
102662283--102662321
17
2.4
17
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12
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15
20
7
56
1.63
102665804--102665850
19
2.5
19
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6
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25
23
10
40
1.87
102668183--102668309
53
2.6
49
77
10
127
27
15
25
30
1.96
102668813--102668855
21
2.2
21
84
15
58
30
4
20
44
1.72
102668813--102668857
18
2.3
20
78
17
51
31
4
20
44
1.71
102670877--102670991
21
5.2
24
72
22
83
62
0
8
28
1.25
102670905--102670991
44
2.0
44
82
13
108
65
0
8
26
1.20
102670903--102671031
15
8.9
14
72
18
70
65
1
6
25
1.26
102670924--102671031
29
3.8
28
73
22
73
64
1
7
25
1.30
102674172--102674240
35
2.0
35
100
0
138
36
11
5
46
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102676826--102677072
118
2.1
118
95
0
440
38
7
15
38
1.76
102680462--102680570
39
2.8
39
88
2
157
23
21
27
27
1.99
102687177--102687219
12
3.5
12
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3
50
41
0
0
58
0.98
102687165--102687219
24
2.2
25
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3
67
49
0
0
50
1.00
102687309--102687382
29
2.6
29
79
12
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54
2
1
41
1.23
102688704--102688953
4
62.5
4
91
0
356
26
5
24
44
1.75
102689014--102689067
23
2.3
23
87
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25
11
20
42
1.85
102689405--102689471
29
2.3
28
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14
82
32
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49
1.64
102690407--102690466
10
6.0
10
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102691920--102691959
21
1.9
21
100
0
80
30
27
15
27
1.96
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2
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2
92
0
51
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0
50
1.18
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2
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100
0
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0
0
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1.00
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2.3
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50
20
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15
1.78
102701564--102701595
15
2.1
15
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0
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2.0
30
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0
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25
10
25
38
1.87
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18
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60
1
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33
1.25
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120
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1
5
31
1.27
102706423--102706501
33
2.3
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0
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1.28
102706423--102706491
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88
59
0
8
31
1.28
102710250--102710297
23
2.1
23
84
3
62
75
0
4
20
0.97
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1.9
208
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20
7
51
1.71
102720870--102720901
1
32.0
1
100
0
64
100
0
0
0
0.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102722267--102722315
19
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19
96
0
89
36
18
16
28
1.92
102725406--102725462
27
2.1
28
83
3
71
36
3
10
49
1.55
102728701--102728745
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0
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0
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0.92
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2
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0
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0
0
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1.00
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1.89
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2.0
17
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0
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1.45
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0
0
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0
0
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2.6
22
83
8
80
14
24
19
42
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427