Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  410  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119148885--119148934
20
2.5
20
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15
57
52
8
12
28
1.66
119149856--119149916
26
2.4
25
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15
63
49
1
1
47
1.21
119157744--119157784
19
2.2
19
86
8
57
65
0
4
29
1.13
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3
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3
100
0
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0
0
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0.91
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2.0
29
90
9
93
57
8
3
30
1.45
119168561--119168603
22
2.0
22
85
0
59
58
9
11
20
1.61
119168568--119168608
11
3.7
11
80
0
55
56
7
14
21
1.63
119168569--119168618
22
2.3
22
86
6
66
60
4
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20
1.52
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5
57
28
0
6
65
1.16
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2.8
35
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20
89
50
1
3
45
1.24
119174664--119174696
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2.0
17
88
5
50
60
0
24
15
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119191714--119191772
25
2.7
21
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20
66
30
3
1
64
1.20
119194119--119194304
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3.7
50
82
9
166
29
29
16
25
1.97
119194166--119194304
53
2.6
53
89
3
201
30
28
16
25
1.97
119200026--119200098
29
2.5
29
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10
78
2
20
0
76
0.90
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0
30
1.01
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2.1
19
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9
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55
0
0
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0.99
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2.0
30
83
10
75
53
5
1
39
1.33
119202741--119202779
2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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16
2.8
16
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7
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2
2
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119205423--119205521
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3.2
33
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19
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21
16
16
46
1.84
119205397--119205524
61
2.1
61
97
1
238
21
14
17
45
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119210667--119210730
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2.6
25
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62
43
1
3
51
1.26
119220365--119220393
14
2.1
14
100
0
58
27
20
0
51
1.47
119221337--119221402
21
3.1
21
82
6
71
39
4
0
56
1.20
119222316--119222368
28
1.9
27
85
11
72
18
5
20
54
1.64
119222314--119222374
28
2.2
27
77
8
70
16
4
18
60
1.52
119222551--119222585
16
2.2
17
90
10
56
57
0
2
40
1.14
119222559--119222622
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2.5
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46
3
1
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0
50
0
20
0
80
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35
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26
1.93
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44
2.6
44
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2
149
35
13
22
27
1.92
119236585--119236718
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
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16
2.2
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10
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57
0
2
40
1.14
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26
2.5
24
80
9
65
46
3
1
48
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103
2.0
103
100
0
412
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19
13
39
1.89
119251031--119251075
19
2.3
20
92
3
74
48
8
11
31
1.69
119251059--119251096
14
2.7
14
95
0
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34
5
7
52
1.53
119256675--119256714
19
2.1
19
100
0
80
50
0
30
20
1.49
119256955--119256997
2
21.5
2
100
0
86
51
0
48
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1.00
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2.1
20
91
4
68
23
0
0
76
0.78
119258671--119258713
10
4.3
10
88
8
61
23
0
0
76
0.78
119259581--119259634
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2.9
17
78
15
54
31
1
0
66
1.02
119259587--119259634
9
4.9
10
78
14
55
33
2
0
64
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119261115--119261139
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12
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50
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0
0
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0.63
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1.9
20
88
0
58
34
2
0
63
1.09
119270625--119270668
21
2.1
21
83
8
54
47
4
0
47
1.22
119270744--119270782
14
3.0
13
82
10
53
53
0
0
46
1.00
119274751--119274778
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5.6
5
100
0
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21
0
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0.75
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17
80
8
59
1
21
3
72
1.11
119279539--119279591
17
3.1
17
73
10
54
1
22
3
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1.12
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2.0
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100
0
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1.71
119284122--119284229
21
5.0
22
84
5
123
14
22
25
37
1.93
119284121--119284229
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2.5
43
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166
15
22
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2.1
26
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23
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1.12
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1.9
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38
8
0
52
1.33
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4.2
6
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0
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84
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35
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0
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34
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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34
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
25
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8
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68
2
0
29
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427