Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  355  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103320633--103320802
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103320648--103320764
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3.0
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10
140
29
10
25
35
1.89
103320637--103320807
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0
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0
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23
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72
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2.4
24
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40
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44
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2.5
28
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27
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24
2.4
24
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48
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42
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9
42
1.60
103345414--103345447
13
2.6
13
90
9
52
26
2
14
55
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103347811--103348060
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88
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13
38
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103349148--103349176
13
2.1
14
93
6
51
65
0
6
27
1.18
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2.4
16
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8
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53
2
5
38
1.37
103351855--103352022
85
2.0
85
91
0
273
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1
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1.16
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2.0
234
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2.0
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26
13
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31
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313
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17
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32
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140
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23
13
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1.91
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0
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2.0
21
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2.0
28
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21
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19
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20
2.0
20
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2.7
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2.0
17
100
0
68
35
11
29
23
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103378129--103378185
28
2.0
29
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1
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1.21
103380555--103380627
18
4.1
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72
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1
30
1.20
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2.1
19
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10
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2.0
22
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17
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0
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144
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5
1662
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1.81
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10
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3
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0
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0
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12
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13
0
0.94
103435107--103435139
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13
90
9
59
48
0
15
36
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23
1.9
23
85
0
61
36
6
11
45
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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3
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22
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28
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19
19
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1.9
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0
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1.67
103441484--103441631
48
3.1
48
92
0
242
37
8
24
29
1.84
103444603--103444662
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0
3
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12
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0
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2.0
29
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2
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1
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103469561--103469630
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1.41
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9
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0
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1.87
103479811--103479845
18
1.9
18
100
0
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1.85
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2.3
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103481017--103481115
48
2.0
49
92
1
164
39
2
14
44
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.80
103515432--103515567
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60
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2.1
32
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2
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18
0
28
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103526890--103526928
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2.0
80
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1.79
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3.3
62
89
1
305
25
26
18
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427