Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr11 124536837 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  341  of  427  ( 51162 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Score
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Indices
Period
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C
G
T
Entropy
(0-2)
99623441--99623474
11
3.2
11
91
8
61
85
0
14
0
0.60
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19
2.1
19
85
4
53
33
2
7
56
1.41
99632267--99632373
54
2.0
54
94
0
187
61
4
20
13
1.49
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7
4.6
7
100
0
64
31
0
43
25
1.55
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131
3.0
130
80
5
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18
28
1.93
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133
1.9
134
84
5
346
28
17
25
28
1.97
99653728--99654118
131
3.0
130
80
4
403
27
18
17
36
1.94
99662822--99662865
21
2.1
21
95
0
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0
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22
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22
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5
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2.1
137
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0
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19
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0
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1.58
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39
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1
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2.0
241
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17
2.1
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29
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3.0
303
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19
2.1
19
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205
33
25
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26
1.95
99688428--99688622
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50
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203
32
25
15
26
1.96
99688493--99688622
52
2.6
50
87
2
170
35
27
12
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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57
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0
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25
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13
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0
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2
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2.0
589
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1.96
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15
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0
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13
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2.0
179
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27
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27
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0
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260
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303
33
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1.92
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10
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0
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0
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29
90
0
322
34
12
27
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99744861--99745029
33
5.1
33
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2
187
35
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30
1.91
99744861--99745069
98
2.1
99
81
6
264
36
13
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27
1.92
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2.5
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1.28
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0
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2.6
100
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301
38
18
12
30
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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