Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  212  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
22
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1.99
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48
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207
26
22
22
28
1.99
59760517--59760660
71
2.0
72
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4
220
26
22
22
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1.99
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27
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40
1.80
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2.0
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5
196
31
8
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1.82
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2.0
50
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2.5
41
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20
19
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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66
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9
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1.28
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3.4
34
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26
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1.89
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37
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0
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1.94
59798331--59798511
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2.2
81
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274
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1.94
59812166--59812245
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1.84
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31
22
6
39
1.80
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21
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27
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5.7
48
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261
26
19
24
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59827017--59827043
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1.95
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23
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102
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17
25
25
1.97
59827122--59827223
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23
79
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34
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23
24
1.96
59827122--59827207
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1.9
45
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17
25
25
1.97
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29
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20
1.98
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19
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0
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0
0
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1
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9
29
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1.88
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18
1.9
17
88
11
50
18
27
39
15
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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1.90
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0
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0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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95
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308
27
17
29
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59996673--59996947
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2
253
25
30
17
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427