Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  49  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11845980--11846042
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0
0
50
1.00
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26
2.8
21
71
26
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25
12
0
61
1.31
11853950--11853982
12
2.8
12
100
0
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11854014--11854295
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2
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0
0
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1
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1
0
30
0.98
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0
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0
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1.00
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58
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2.0
27
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24
15
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11862485--11862619
26
5.2
26
92
1
227
37
24
5
33
1.78
11866789--11866841
26
2.0
26
82
7
63
24
15
20
39
1.91
11869355--11869412
25
2.2
26
85
11
75
37
6
3
51
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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7
206
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3
24
37
1.74
11875834--11875910
23
3.3
24
90
5
122
11
24
50
12
1.74
11875834--11875910
35
2.2
35
92
0
127
11
24
50
12
1.74
11875834--11875910
12
6.6
12
92
5
122
11
24
50
12
1.74
11880769--11880897
24
5.2
25
90
7
203
34
4
23
37
1.76
11882375--11882427
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
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11882674--11882959
136
2.1
137
96
0
520
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25
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22
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26
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27
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2
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28
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25
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1.94
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192
2.0
192
98
0
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19
24
1.98
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1.9
18
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11
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0
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31
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60
64
0
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18
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20
1.81
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7
4.4
7
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0
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1.50
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11
88
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54
34
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48
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11913328--11913416
18
4.9
18
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33
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31
1.91
11913326--11913416
36
2.5
37
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21
13
31
1.92
11920282--11920315
18
1.9
18
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52
17
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61
1.54
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52
2.2
52
98
1
219
19
18
11
50
1.76
11920601--11920648
3
14.7
3
83
12
51
27
2
0
70
0.98
11920600--11920648
20
2.5
20
87
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66
26
2
0
71
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11920601--11920649
24
2.1
23
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26
2
0
71
0.97
11922188--11922267
22
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22
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18
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37
2
1
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11922181--11922262
40
2.0
40
97
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2
2
57
1.25
11926058--11926146
18
4.9
18
78
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99
32
21
14
31
1.93
11926056--11926146
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2.5
36
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20
15
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0
100
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0
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0
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57
18
0
0
81
0.70
11938645--11938675
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3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
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22
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1.28
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19
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19
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14
12
37
1.84
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2
149
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14
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25
2.0
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25
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23
38
1.91
11959367--11959470
25
4.2
25
84
9
142
36
23
5
34
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11959379--11959470
48
1.9
48
91
4
150
35
23
5
34
1.78
11964337--11964391
12
4.6
12
100
0
110
14
50
25
9
1.72
11965646--11965929
134
2.1
137
96
2
520
31
25
18
24
1.97
11967683--11967791
26
4.2
26
92
1
175
36
23
5
33
1.78
11971198--11971332
26
5.2
26
94
1
227
36
25
5
33
1.78
11971198--11971332
51
2.6
52
96
1
245
36
25
5
33
1.78
11979156--11979405
45
5.6
43
71
14
143
25
20
20
32
1.97
11978965--11979422
138
3.3
138
92
0
747
26
19
19
33
1.96
11979339--11979443
41
2.5
44
84
4
126
26
20
18
34
1.96
11979347--11979443
44
2.3
41
83
5
113
28
18
18
34
1.95
11995560--11995591
14
2.1
16
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11
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53
6
0
40
1.26
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136
2.1
136
96
0
525
31
24
18
24
1.97
11998875--11998922
21
2.3
21
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7
62
33
52
2
12
1.51
12000654--12000763
26
4.2
26
92
0
175
37
23
5
33
1.78
12001286--12001343
28
2.0
30
90
6
93
6
17
6
68
1.34
12001289--12001350
28
2.1
30
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5
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6
19
8
66
1.40
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0
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2
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1.02
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18
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30
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1
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1.36
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2.0
27
85
7
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24
15
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37
1.92
12010198--12010307
26
4.2
26
97
0
202
37
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4
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1.76
12013269--12013294
13
2.0
13
100
0
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30
0
7
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1.24
12014447--12014495
25
2.0
26
84
8
66
24
16
20
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12015984--12016067
26
3.2
26
96
0
150
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25
4
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1.77
12022359--12022410
22
2.3
22
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1
0
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1.06
12023650--12023687
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.3
31
83
9
85
31
4
12
51
1.59
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17
2.4
19
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11
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2
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1.24
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21
2.0
21
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0
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19
29
21
29
1.98
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2.0
21
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0
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19
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21
29
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2.1
136
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0
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24
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25
31
1.98
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2.1
51
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3
182
34
4
24
37
1.76
12039212--12039319
25
4.2
26
94
3
184
34
4
24
37
1.76
12041100--12041385
137
2.1
136
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0
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24
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0
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0
0
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19
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20
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0
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12051924--12051963
2
20.0
2
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0
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1.23
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2.0
15
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51
27
0
6
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1.18
12052039--12052140
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2.6
37
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20
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32
4
4
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1.41
12053823--12053858
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12059046--12059468
71
6.2
69
75
12
403
24
14
22
39
1.91
12059188--12059434
122
2.0
124
90
3
392
24
13
22
39
1.90
12058879--12059471
263
2.3
257
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2
1042
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22
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1.93
12059309--12059474
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15
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18
22
28
1.97
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166
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18
20
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1.96
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1.94
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13
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50
1.65
12060361--12060422
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427