Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  233  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65973712--65973797
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26
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29
22
22
26
1.99
65973678--65973797
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2.4
47
78
9
123
28
23
21
26
1.99
65973845--65973891
20
2.3
20
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34
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65973927--65973974
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1.9
25
82
0
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0
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0
0
51
1.00
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2.00
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200
25
24
25
24
2.00
65982859--65982942
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40
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27
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2.4
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75
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54
46
16
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29
1.74
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114
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3
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2.0
20
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20
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2.0
15
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53
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16
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2.0
41
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0
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2.0
25
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50
0
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2.5
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46
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6.5
40
88
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371
21
22
29
26
1.99
66056514--66056771
80
3.2
80
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421
21
22
29
26
1.99
66056514--66056784
119
2.3
120
86
5
345
21
22
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
32
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15
17
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2.3
43
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13
24
31
1.94
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43
3.4
43
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1
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15
22
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1.8
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199
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20
27
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1.98
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1.8
93
92
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20
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1.98
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2.0
20
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53
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0
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4.2
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196
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26
21
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3.5
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11
15
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1.82
66090570--66090966
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4.7
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1.80
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2.0
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0
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1.06
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172
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19
32
23
1.97
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1.52
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44
2.0
44
100
0
178
41
11
6
40
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66099454--66099528
30
2.6
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80
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89
53
14
2
29
1.55
66101058--66101112
25
2.2
26
83
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69
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7
9
25
1.55
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2.0
18
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54
29
5
5
58
1.45
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2.3
14
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55
51
9
0
38
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16
1.44
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40
15
15
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17
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17
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1.96
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71
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475
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39
1.86
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118
2.0
118
94
0
411
32
27
13
27
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66149838--66149869
2
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2
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57
50
0
0
50
1.00
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23
2.0
23
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8
60
34
17
6
42
1.74
66151921--66151990
23
3.0
23
75
10
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41
15
11
31
1.83
66151904--66151990
23
3.7
23
76
4
68
40
16
11
32
1.84
66154006--66154081
11
7.0
11
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16
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9
7
2
80
1.00
66154019--66154081
27
2.3
26
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5
81
11
6
1
80
0.95
66154024--66154081
21
2.7
21
82
15
66
12
5
1
81
0.94
66155032--66155092
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28
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5
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4
0
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1.23
66155108--66155179
9
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8
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11
1.04
66155108--66155179
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11
1.04
66155207--66155266
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17
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1.03
66155205--66155264
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1
10
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0
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2.0
53
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0
210
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9
40
1.74
66157863--66157949
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3.2
29
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1.73
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11
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0
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0
0
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0.94
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6
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6
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12
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49
15
18
16
1.80
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22
2.8
23
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7
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30
22
25
20
1.98
66163118--66163348
27
8.6
27
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0
257
26
17
18
37
1.93
66163117--66163349
81
2.9
79
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2
286
26
17
18
37
1.93
66163128--66163349
80
2.8
81
83
0
284
27
18
17
37
1.93
66165356--66165404
19
2.6
19
87
12
82
59
14
0
26
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66165739--66165783
19
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19
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0
22
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2.1
20
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0
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1.96
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23
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18
26
1.98
66180768--66180889
46
2.6
46
87
6
156
23
31
19
25
1.98
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138
1.9
137
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3
377
20
22
16
40
1.91
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6.0
46
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0
325
21
22
15
40
1.91
66192386--66192659
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3.0
91
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2
359
21
22
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1.91
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2.0
29
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30
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1.92
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28
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1.93
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2.3
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1.97
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2.0
51
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0
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22
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28
1.99
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43
92
0
265
12
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1.93
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25
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103
23
19
17
39
1.92
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25
2.9
25
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0
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24
20
19
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1.95
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5.1
40
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1
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23
20
29
27
1.99
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2
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24
20
27
27
1.99
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2.0
46
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0
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1.91
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2.0
59
100
0
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18
15
34
1.92
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5.5
40
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23
22
1.99
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3.7
47
76
10
174
26
19
24
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66255906--66256119
46
4.6
46
77
10
211
24
20
25
30
1.98
66255859--66256073
93
2.3
93
90
0
340
25
19
24
30
1.98
66260047--66260079
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2.1
16
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5
50
39
0
3
57
1.14
66266103--66266630
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10.9
49
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2
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9
27
28
1.88
66266103--66266630
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5.5
96
96
0
894
34
9
27
28
1.88
66266103--66266630
145
3.6
145
93
2
875
34
9
27
28
1.88
66266622--66266834
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4.2
48
75
16
212
32
5
28
32
1.81
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13
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0
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29
0
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1.55
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61
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2
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4
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1.77
66266679--66266717
13
2.8
13
92
7
60
25
0
28
46
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427