Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  126  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33465054--33465102
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14
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90
0
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14
15
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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12
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33504818--33505042
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2.1
105
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2.2
18
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0
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2.0
20
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1.99
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3.0
50
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22
31
1.98
33532674--33532844
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254
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22
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1.99
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28
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25
25
2.00
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2.0
55
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14
30
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33593244--33593362
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4.2
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159
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15
29
25
1.96
33599716--33599881
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4.2
40
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25
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1.98
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26
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1.99
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23
21
26
1.99
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4
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4
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0
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0
0
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0.80
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Period
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Copy
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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1.96
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1.99
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17
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
40
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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