Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  335  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97662743--97662790
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2.1
23
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0
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10
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97662755--97662802
23
2.1
23
88
0
69
20
10
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18
1.76
97663522--97663598
30
2.5
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4
93
44
1
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49
1.33
97663522--97663609
30
2.9
30
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43
1
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2
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2.5
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270
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5
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1.79
97710815--97710973
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3.1
51
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3
268
36
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5
33
1.79
97715083--97715135
26
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26
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220
36
22
5
34
1.79
97716619--97716753
51
2.6
52
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229
36
22
5
34
1.79
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2.8
28
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100
0
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40
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29
2.1
29
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79
49
8
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1.62
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22
2.0
22
100
0
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44
13
23
18
1.86
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77
1.9
77
84
4
201
48
5
16
29
1.67
97746512--97746661
39
3.9
37
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165
48
5
16
29
1.68
97747185--97747244
2
31.0
2
83
6
79
45
1
1
51
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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6
1.26
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207
4.7
209
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6
1166
28
17
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31
1.97
97760223--97760333
45
2.5
45
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1
152
31
11
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24
1.91
97761547--97761650
39
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1.9
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210
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17
29
1.70
97761547--97761695
38
3.9
39
89
3
196
47
5
17
29
1.70
97762215--97762270
2
29.0
2
82
7
71
44
1
1
51
1.22
97766172--97766202
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15
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0
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1.26
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204
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207
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1088
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22
31
1.96
97774115--97774959
208
4.1
210
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4
1153
28
17
22
31
1.97
97775157--97775267
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2.5
45
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152
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1.91
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1.9
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203
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29
1.69
97776493--97776642
39
3.9
38
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185
48
5
17
29
1.69
97777161--97777225
25
2.7
24
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3
56
1.30
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0
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1.60
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15
100
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2.1
18
89
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62
5
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1.18
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15
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6
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63
1.18
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2.5
31
76
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82
43
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0
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1.08
97798377--97798415
21
1.9
19
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17
10
10
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6.7
7
90
0
76
27
2
12
57
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97809583--97809646
30
2.1
30
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0
92
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1.75
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131
5.4
130
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5
1120
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4
3
55
1.39
97810125--97810840
264
2.7
260
91
3
1148
36
4
3
55
1.39
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125
2.5
125
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458
27
18
15
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1.91
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5
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37
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2
60
1.09
97814270--97814313
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1.11
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11
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Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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28
21
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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15
23
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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