Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   

This is table  303  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87797396--87797538
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3.0
48
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7
202
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22
22
27
1.99
87797396--87797539
71
2.0
72
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213
28
22
22
27
1.99
87797730--87797793
31
2.1
31
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0
101
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87799605--87799629
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2.1
12
100
0
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0
0
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0.90
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0
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32
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22
1.98
87803231--87803335
27
3.9
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20
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22
1.9
22
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68
69
0
28
2
1.01
87814625--87815799
142
8.1
142
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5
1702
27
6
7
59
1.48
87814625--87815799
290
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285
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1671
27
6
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59
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0
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0
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2.1
27
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0
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100
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0
0
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0.90
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2.1
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53
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39
1.28
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2.6
27
95
0
120
17
28
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87832378--87832436
26
2.4
24
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8
66
37
6
11
44
1.68
87832373--87832430
26
2.2
26
81
6
73
41
6
8
43
1.62
87837707--87837847
72
2.0
72
90
2
221
31
20
26
21
1.98
87839720--87840933
153
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148
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10
1273
29
7
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1.53
87840462--87840497
12
2.8
13
87
4
56
22
2
0
75
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87839720--87840933
298
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296
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29
7
6
56
1.53
87840644--87840920
133
2.1
135
84
5
364
29
7
6
56
1.53
87841289--87841316
6
4.7
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0
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0
0
17
0.68
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14
4.4
14
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15
56
0
29
0
70
0.87
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18
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51
0
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0
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16
3.4
16
78
19
62
0
31
0
68
0.90
87841472--87841545
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1.9
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10
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0
36
0
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0.95
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19
2.3
18
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4
59
9
9
4
76
1.14
87843517--87843555
14
2.7
15
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4
53
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10
0
23
1.22
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31
2.0
31
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11
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2
100
0
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0
0
50
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0
0
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1.00
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2.0
17
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0
50
23
29
23
23
1.99
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17
2.0
17
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42
3
6
48
1.43
87862247--87862494
50
4.9
50
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1
325
25
17
26
30
1.97
87862247--87862494
101
2.5
100
87
0
343
25
17
26
30
1.97
87862247--87862529
151
1.9
151
87
0
413
25
17
27
30
1.97
87863440--87864079
324
2.0
325
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25
1.9
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0
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35
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22
1.91
87888328--87888389
19
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0
1
54
1.09
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31
2.3
31
87
2
97
29
8
15
46
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87893105--87893142
18
2.1
18
90
0
58
68
0
15
15
1.22
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24
1.9
24
95
0
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43
6
23
26
1.78
87902956--87903123
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
87907281--87907355
33
2.3
34
81
4
100
25
18
24
32
1.97
87913886--87913953
28
2.4
29
92
2
111
25
14
32
27
1.95
87919893--87919996
52
2.0
53
83
5
131
54
1
6
36
1.38
87920082--87920203
28
4.5
28
72
10
101
60
2
4
31
1.31
87920094--87920203
26
4.1
26
76
10
96
60
2
4
32
1.31
87920068--87920187
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2.1
55
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7
143
63
2
4
30
1.26
87920216--87920297
28
3.3
23
76
15
76
64
7
3
24
1.35
87920219--87920297
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25
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10
95
64
7
3
24
1.36
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133
2.1
132
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337
27
23
19
29
1.98
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9.0
44
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3
258
26
22
18
32
1.97
87921983--87922313
44
7.5
44
75
3
216
26
22
19
30
1.98
87921983--87922270
89
3.2
89
80
3
294
27
23
19
29
1.98
87921866--87922262
177
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176
79
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431
26
22
18
32
1.97
87922017--87922313
133
2.2
132
85
2
382
26
23
19
30
1.98
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2.7
12
100
0
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21
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19
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20
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100
0
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24
1.42
87935622--87935982
25
13.4
25
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16
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Indices
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Percent
Indels
Score
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T
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46
1.13
Indices
Period
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1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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30
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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