Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  191  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52914226--52914330
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1.9
55
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0
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2.0
270
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2.00
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39
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118
21
28
21
29
1.98
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40
4.2
40
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2
185
25
27
21
25
1.99
52947885--52948051
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2.1
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83
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205
25
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21
25
1.99
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18
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1
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1.96
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39
3.5
39
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9
138
24
28
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24
1.99
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39
3.8
39
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24
28
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23
2.00
53006222--53006360
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3.5
40
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5
122
25
28
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53006263--53006411
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38
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5
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22
24
2.00
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2.0
29
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0
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2
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0
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0
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2.0
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1.94
53024953--53025162
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7.7
27
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2.2
54
93
0
202
38
5
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1.79
53025194--53025312
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5
25
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1.79
53025194--53025330
54
2.5
54
89
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184
37
5
24
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1.79
53030249--53030376
39
3.3
39
91
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202
21
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19
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19
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2.0
30
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47
6
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1.74
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1.98
53061499--53061541
19
2.4
17
81
14
50
46
0
2
51
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53061509--53061571
22
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0
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0
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44
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52
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17
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1.94
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26
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1.99
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21
29
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1.99
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39
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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0
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1.98
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26
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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0
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0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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37
1.84

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