Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  43  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Period
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Copy
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Indels
Score
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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10694295--10694402
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2.1
51
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173
37
23
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34
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2.1
135
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10728546--10728585
12
3.4
12
86
3
55
17
0
5
77
0.94
10728560--10728584
10
2.5
10
100
0
50
16
0
8
76
1.02
10728963--10729031
35
2.0
35
94
0
120
21
10
49
18
1.77
10729306--10729587
74
3.7
74
86
6
381
34
19
15
31
1.93
10729581--10729733
73
2.1
73
89
6
238
32
19
17
30
1.95
10729418--10730044
158
3.9
160
88
3
874
33
19
16
30
1.94
10729739--10730044
73
4.0
73
82
9
360
33
20
16
30
1.94
10729902--10730057
74
2.1
73
88
5
242
32
17
16
33
1.92
10742531--10742586
20
2.8
20
81
7
53
57
8
3
30
1.47
10742731--10742765
19
1.9
19
88
11
56
54
5
0
40
1.24
10742727--10742768
17
2.5
17
84
7
59
52
7
0
40
1.29
10743288--10743335
18
2.7
18
80
3
53
43
0
56
0
0.99
10743291--10743327
11
3.4
11
92
7
58
45
0
54
0
1.00
10743482--10743522
18
2.3
18
76
19
50
73
0
9
17
1.09
10743485--10743523
17
2.3
17
86
8
53
71
0
10
17
1.12
10745135--10745223
30
3.0
30
79
14
103
65
1
2
31
1.12
10749269--10749339
23
3.3
22
76
20
60
61
5
2
29
1.33
10749271--10749339
21
3.1
21
76
21
70
62
5
2
28
1.33
10749554--10749591
19
2.0
20
89
5
60
63
0
7
28
1.23
10750326--10750362
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
10751440--10751974
162
3.3
162
88
6
715
34
19
16
29
1.94
10751660--10751806
75
2.0
75
97
0
276
31
21
17
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10751822--10752046
73
3.1
73
90
2
326
33
21
17
27
1.96
10758262--10758297
18
1.9
19
88
5
56
8
25
13
52
1.68
10764144--10764204
24
2.5
25
82
10
72
72
1
6
19
1.16
10764564--10764601
19
2.0
20
89
5
60
63
0
7
28
1.23
10765423--10765471
2
25.0
2
89
4
73
44
0
0
55
0.99
10768519--10768560
20
2.0
21
90
4
68
73
0
14
11
1.09
10769546--10770061
183
2.8
183
87
2
695
26
24
18
30
1.98
10769268--10770022
44
16.8
44
69
12
288
27
23
19
29
1.98
10772101--10772277
50
3.5
50
89
2
257
35
16
21
26
1.94
10772255--10772401
31
4.7
31
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0
222
25
19
27
26
1.99
10779393--10779507
44
2.6
45
84
5
144
36
13
22
27
1.91
10783872--10783919
25
1.9
25
87
8
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66
4
2
27
1.21
10783940--10784007
25
2.8
24
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16
77
57
1
4
36
1.28
10783903--10784020
21
5.2
23
71
18
79
58
1
7
32
1.36
10783976--10784024
22
2.3
21
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13
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4
4
36
1.38
10783997--10784055
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2.3
25
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1
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32
1.34
10785157--10785199
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0
18
11
1.17
10787814--10787857
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15
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0
2
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0
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11
14
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10794189--10794227
18
2.2
18
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0
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2
51
1.59
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100
0
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0
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0
0.90
10795512--10795552
16
2.5
17
88
4
57
41
0
2
56
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10796062--10796733
296
2.2
300
95
2
1208
33
2
12
52
1.51
10798319--10798370
6
8.7
6
89
0
77
21
32
44
1
1.63
10798319--10798370
18
2.9
18
88
0
86
21
32
44
1
1.63
10798582--10798631
20
2.4
21
96
3
93
32
4
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58
1.41
10810968--10811098
3
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3
74
8
108
59
2
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1.36
10811061--10811117
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2.2
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29
1.28
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5
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2
0
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0.79
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0
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22
18
30
1.98
10812054--10812452
179
2.2
179
84
3
509
27
22
18
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427