Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  407  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118179738--118179771
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0
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0
0
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0
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3.5
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60
2
0
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1.09
118192109--118192149
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2
0
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1.45
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0
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61
42
0
2
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3
41
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2.6
29
82
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4
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49
1.29
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2.1
22
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36
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0
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1.9
132
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0
0
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100
0
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0
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25
2.7
26
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17
72
49
1
2
46
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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2
11
2
82
0.89
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6
0
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1.25
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11
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11
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65
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2.3
29
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5
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23
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21
23
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38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
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11
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0
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93
94
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3.0
30
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10
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16
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0
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118289241--118289301
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2.3
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13
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63
1
0
34
1.04
118289240--118289306
28
2.5
28
83
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86
65
1
0
32
1.02
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62
0
0
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2.9
18
78
18
56
39
0
0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
118289890--118289945
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0
0
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0.94
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3.2
20
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33
0
1
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1.03
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100
0
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0
0
50
1.00
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0
66
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0
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0
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2.0
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410
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106
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0
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0
0
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1.9
29
89
3
87
43
5
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42
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.54
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2.4
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5
44
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3.2
50
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0
243
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14
23
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
115
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2
336
45
12
5
36
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118444161--118444218
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1.95
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3.0
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4
153
35
12
23
28
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427