Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  143  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38700403--38700482
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2.9
28
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20
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2
5
23
1.21
38700403--38700482
28
2.9
29
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68
2
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1.21
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0
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0
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55
20
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1.64
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28
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40
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1.98
38762574--38762729
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53
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21
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0
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19
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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3
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3
79
10
130
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2
3
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3
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0
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33
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16
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2
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1.34
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0
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1.97
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39
5.1
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3
174
22
20
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25
1.98
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2.0
21
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1.86
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1.88
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0
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31
1.21
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1.13
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1.34
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2.0
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2.5
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25
0
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0
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19
19
1.91
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2.7
46
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2
150
21
13
28
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38833052--38833088
19
1.9
19
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1.99
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5.9
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23
31
20
24
1.98
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39
94
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332
23
32
19
24
1.98
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5.9
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304
23
32
19
24
1.98
38846789--38847020
77
3.0
78
88
2
322
23
32
19
24
1.98
38846820--38847020
39
5.2
39
91
1
305
23
32
18
24
1.97
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1.8
117
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289
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32
18
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1.97
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25
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1.99
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37
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140
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28
22
24
1.99
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47
76
14
192
30
30
19
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1
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25
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80
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0
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66
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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382
27
20
18
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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1.94
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2.1
39
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2
139
40
12
23
24
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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