Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr11 124536837 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  124536837

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  30  of  427  ( 51162 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7784546--7784604
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2.6
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7801776--7801817
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10
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2
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2.0
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0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7831279--7831320
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2.2
32
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19
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19
18
1.90
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1
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10
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23
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7844286--7844472
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84
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29
27
20
22
1.98
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37
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24
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2.0
293
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14
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3
78
3
127
34
5
1
58
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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19
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17
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2.0
22
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47
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1.63
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10
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28
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47
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18
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1.63
7880457--7880498
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4.0
18
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0
90
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13
22
30
1.93
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1.9
36
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0
102
33
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2.0
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2
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1.63
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10
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16
1
4
77
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7918383--7918430
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2.8
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14
2
4
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0.98
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19
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19
79
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19
19
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0
30
1.52
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26
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36
24
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1.78
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197
2.0
198
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2
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26
9
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2.0
96
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19
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38
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10
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0
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1.96
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1.9
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29
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1.96
7950775--7950899
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2.7
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1.96
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2
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29
26
17
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
1.98
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50
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1.94
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2
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100
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74
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223
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19
16
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
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24
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5.2
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22
1.99
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1.9
16
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0
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2
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0
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0
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26
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1.97
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1.9
131
92
1
411
25
25
17
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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